142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2316 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2316  hypothetical protein  100 
 
 		 866 aa  1718    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.824305  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  28.61 
 
 		 753 aa  196  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  25.37 
 
 		 875 aa  181  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  24.62 
 
 		 831 aa  172  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  25.56 
 
 		 806 aa  171  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  24.4 
 
 		 775 aa  169  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  24.32 
 
 		 881 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  23.03 
 
 		 792 aa  162  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 		 772 aa  162  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  22.81 
 
 		 789 aa  159  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  23.69 
 
 		 775 aa  159  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  24.03 
 
 		 874 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 787 aa  154  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  24.52 
 
 		 772 aa  151  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  28.04 
 
 		 888 aa  148  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  24.38 
 
 		 814 aa  148  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  24.31 
 
 		 804 aa  142  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  22.43 
 
 		 791 aa  140  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  24.54 
 
 		 800 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 923 aa  138  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 791 aa  138  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0255  TonB-dependent receptor  23.16 
 
 		 852 aa  137  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.786505  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  22.99 
 
 		 780 aa  131  6e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  20.55 
 
 		 872 aa  130  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  25.95 
 
 		 800 aa  126  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0030  TonB-dependent receptor plug  25.84 
 
 		 786 aa  125  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  21.78 
 
 		 793 aa  121  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  22.68 
 
 		 790 aa  121  4.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1696  TonB-dependent receptor  22.39 
 
 		 756 aa  119  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  22.76 
 
 		 923 aa  115  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  21.08 
 
 		 917 aa  110  8.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  23.36 
 
 		 803 aa  109  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  25.99 
 
 		 902 aa  92  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0905  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 1181 aa  81.3  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000345884 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  21.46 
 
 		 928 aa  70.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  22.77 
 
 		 1114 aa  68.6  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  22.62 
 
 		 1150 aa  64.3  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  22.99 
 
 		 797 aa  63.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  30.3 
 
 		 1066 aa  62.8  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4145  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 865 aa  62  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0626141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  26.69 
 
 		 1153 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1354  TonB-dependent receptor plug  24.26 
 
 		 1230 aa  59.3  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  27.55 
 
 		 767 aa  58.9  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  23.03 
 
 		 1132 aa  58.5  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  25.5 
 
 		 1139 aa  58.2  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2533  TonB-dependent receptor  20.81 
 
 		 800 aa  58.2  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  26.82 
 
 		 894 aa  57.8  0.0000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  32.54 
 
 		 906 aa  57.8  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4255  TonB-dependent receptor, plug  26.18 
 
 		 1034 aa  57.4  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 852 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  23.6 
 
 		 1116 aa  57.4  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  27.91 
 
 		 1177 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  28.97 
 
 		 1019 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  26.69 
 
 		 777 aa  57.4  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 897 aa  57.4  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3424  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 815 aa  57  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.053865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  27.36 
 
 		 1109 aa  57  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2857  TonB-dependent receptor plug  24.39 
 
 		 1148 aa  55.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.22615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3148  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 1119 aa  55.8  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  31.69 
 
 		 859 aa  55.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  22.67 
 
 		 1144 aa  54.7  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  24.47 
 
 		 1127 aa  54.7  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5486  TonB-dependent receptor plug  25.89 
 
 		 1147 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.067232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0640  TonB-dependent receptor plug  23.05 
 
 		 1125 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  23.53 
 
 		 1120 aa  53.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  25.33 
 
 		 1163 aa  53.5  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 730 aa  53.5  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 1154 aa  53.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 1175 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  24.29 
 
 		 779 aa  53.1  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  23.29 
 
 		 1102 aa  52.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  24.11 
 
 		 1101 aa  52.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  26.82 
 
 		 1188 aa  52.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  26.81 
 
 		 1161 aa  52.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  26.85 
 
 		 1097 aa  52.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  25.42 
 
 		 988 aa  52  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  31.07 
 
 		 1173 aa  52  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  22.57 
 
 		 1094 aa  51.6  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1487  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 958 aa  51.6  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 818 aa  51.2  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  27.87 
 
 		 1021 aa  51.2  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 994 aa  51.2  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  23.92 
 
 		 1154 aa  50.8  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4954  TonB-dependent receptor plug  33.06 
 
 		 1182 aa  50.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0461208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2671  TonB-dependent receptor plug  21.79 
 
 		 1202 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000367152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5147  TonB-dependent receptor plug  24.64 
 
 		 1164 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0557034  normal  0.0156539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  23.23 
 
 		 1138 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  26.25 
 
 		 1077 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  25.74 
 
 		 1051 aa  50.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 1119 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  24.44 
 
 		 1146 aa  49.7  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4497  TonB-dependent receptor plug  23 
 
 		 1198 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0452901  normal  0.421044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3996  TonB-dependent receptor plug  24.24 
 
 		 1204 aa  48.9  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238873  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  23.83 
 
 		 815 aa  48.5  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  25.71 
 
 		 1071 aa  48.5  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  25.43 
 
 		 914 aa  48.5  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 897 aa  48.1  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  25.93 
 
 		 986 aa  47.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  22.25 
 
 		 1155 aa  47.8  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  21.87 
 
 		 1123 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>