160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5509 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1054 aa  2131    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  30.51 
 
 		 1122 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  30.54 
 
 		 1120 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  30.51 
 
 		 1109 aa  426  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  30.46 
 
 		 1126 aa  422  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  25.85 
 
 		 972 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  25 
 
 		 1007 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  24.64 
 
 		 1007 aa  176  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 1007 aa  170  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 993 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 1188 aa  138  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  27.57 
 
 		 1001 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  28.67 
 
 		 994 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02821  OmpA-related protein  26.17 
 
 		 485 aa  127  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00282883  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  31.6 
 
 		 991 aa  125  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  32.69 
 
 		 1066 aa  124  9e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  26.86 
 
 		 997 aa  121  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 1066 aa  119  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 		 1105 aa  108  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  30.58 
 
 		 1075 aa  106  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  26.25 
 
 		 1037 aa  103  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 888 aa  96.3  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  27.02 
 
 		 1141 aa  94.7  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  31.2 
 
 		 897 aa  93.6  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 1041 aa  89.4  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  29.29 
 
 		 1066 aa  89.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  24.58 
 
 		 1203 aa  89  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  29.24 
 
 		 1162 aa  89.4  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  25.53 
 
 		 1056 aa  88.6  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  25.37 
 
 		 1050 aa  88.6  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  28.66 
 
 		 1161 aa  88.6  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  28.25 
 
 		 1074 aa  86.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 1176 aa  86.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  27.91 
 
 		 1069 aa  85.5  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 935 aa  85.1  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  23.26 
 
 		 986 aa  85.1  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4161  hypothetical protein  26.29 
 
 		 1008 aa  85.1  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000881228  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  25.24 
 
 		 1071 aa  83.2  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  26.54 
 
 		 1068 aa  83.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  26.56 
 
 		 1210 aa  83.2  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  26.06 
 
 		 1052 aa  82.8  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 1123 aa  81.6  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 952 aa  81.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  26.13 
 
 		 1125 aa  80.1  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  24.45 
 
 		 1257 aa  80.1  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  24.92 
 
 		 1074 aa  78.6  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1196 aa  78.2  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  24.05 
 
 		 1097 aa  78.2  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  26.73 
 
 		 992 aa  78.2  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  28.71 
 
 		 1125 aa  77  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  27.63 
 
 		 1194 aa  76.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 1149 aa  76.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  24.48 
 
 		 1075 aa  75.9  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  25.17 
 
 		 1298 aa  75.5  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  23.16 
 
 		 1053 aa  73.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  25.5 
 
 		 1067 aa  74.3  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 1089 aa  73.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 1123 aa  72.8  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 1232 aa  72.8  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  25.85 
 
 		 511 aa  72.4  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 1153 aa  72.4  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  26.47 
 
 		 1100 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 1206 aa  68.2  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  23.97 
 
 		 1195 aa  68.2  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 		 1065 aa  67  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  27.06 
 
 		 859 aa  66.6  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  25.67 
 
 		 1008 aa  66.6  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 1167 aa  65.9  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  22.73 
 
 		 1132 aa  65.9  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 1008 aa  65.1  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  24.73 
 
 		 1081 aa  65.1  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 966 aa  64.7  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 1114 aa  64.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 1087 aa  64.3  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  22.7 
 
 		 1051 aa  63.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 1124 aa  63.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  25.42 
 
 		 1116 aa  62.4  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  22.54 
 
 		 1105 aa  60.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  23.26 
 
 		 1068 aa  61.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  27.85 
 
 		 1041 aa  60.1  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 1016 aa  60.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  25.52 
 
 		 1066 aa  60.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  27.34 
 
 		 777 aa  59.3  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4595  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 781 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  24.44 
 
 		 1071 aa  58.9  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0900  TonB-dependent siderophore receptor  26.07 
 
 		 781 aa  58.5  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0456364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  22.71 
 
 		 1026 aa  58.5  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  26.7 
 
 		 800 aa  58.5  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  25.55 
 
 		 966 aa  58.2  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  27.78 
 
 		 810 aa  57.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  22.7 
 
 		 1057 aa  57.4  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  25.98 
 
 		 979 aa  56.6  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  23.88 
 
 		 1010 aa  56.6  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 845 aa  57  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  34.31 
 
 		 957 aa  56.2  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  24.66 
 
 		 1077 aa  56.2  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  29.11 
 
 		 906 aa  54.7  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 828 aa  54.7  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  23.17 
 
 		 1061 aa  54.3  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 836 aa  54.3  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>