264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7227 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  40.66 
 
 		 874 aa  637    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 875 aa  1805    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  38.62 
 
 		 789 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  36.72 
 
 		 806 aa  533  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  38.12 
 
 		 804 aa  525  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  32.54 
 
 		 881 aa  473  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  35.98 
 
 		 772 aa  474  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  34.4 
 
 		 772 aa  461  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  34.61 
 
 		 775 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  34.15 
 
 		 792 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  33.25 
 
 		 793 aa  436  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  33.25 
 
 		 775 aa  429  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  32.39 
 
 		 800 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  34.43 
 
 		 814 aa  409  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  31.35 
 
 		 791 aa  401  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 790 aa  398  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  33.25 
 
 		 787 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  29.86 
 
 		 780 aa  390  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  31.02 
 
 		 923 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  30.01 
 
 		 872 aa  378  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 923 aa  353  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 753 aa  350  7e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 791 aa  344  2.9999999999999997e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0255  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 852 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.786505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  29.27 
 
 		 928 aa  330  7e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  26.46 
 
 		 917 aa  310  1.0000000000000001e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  29.87 
 
 		 803 aa  303  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0030  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 		 786 aa  286  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1696  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 756 aa  276  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  27.47 
 
 		 800 aa  276  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  27.86 
 
 		 888 aa  248  4.9999999999999997e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  27.16 
 
 		 831 aa  246  9e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2316  hypothetical protein  25.37 
 
 		 866 aa  181  5.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.824305  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  23.67 
 
 		 865 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  24.18 
 
 		 771 aa  113  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  24.31 
 
 		 779 aa  105  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  23.84 
 
 		 859 aa  105  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  24.08 
 
 		 797 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  23.46 
 
 		 791 aa  101  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0684  putative TonB-dependent receptor  21.85 
 
 		 701 aa  98.6  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.507206  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  31.14 
 
 		 767 aa  97.8  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  28.77 
 
 		 1102 aa  97.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4145  TonB-dependent receptor  21.42 
 
 		 865 aa  95.5  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0626141 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  22.18 
 
 		 777 aa  94.7  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  25.74 
 
 		 906 aa  93.6  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  28.66 
 
 		 1146 aa  93.6  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  26.35 
 
 		 1106 aa  91.7  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  27.3 
 
 		 1237 aa  91.7  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  21.5 
 
 		 902 aa  87.4  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  23.1 
 
 		 860 aa  85.9  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  25.52 
 
 		 822 aa  85.1  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  28.12 
 
 		 1168 aa  84.7  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 1164 aa  84.3  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  23.16 
 
 		 859 aa  84  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0287  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  23.16 
 
 		 714 aa  79.7  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000460019  hitchhiker  0.00000346512 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  25.25 
 
 		 1138 aa  79  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  25.93 
 
 		 1165 aa  79  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  26.2 
 
 		 1155 aa  79  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3939  hypothetical protein  30.53 
 
 		 649 aa  78.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.462657  normal  0.150476 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  23.62 
 
 		 1188 aa  77.8  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 1189 aa  77.8  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  24.21 
 
 		 1176 aa  77  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  26.19 
 
 		 1102 aa  76.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2831  hypothetical protein  32.88 
 
 		 605 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5660  hypothetical protein  26.27 
 
 		 588 aa  75.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  25.27 
 
 		 1186 aa  75.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  24.01 
 
 		 1109 aa  75.5  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 897 aa  75.1  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  25.07 
 
 		 821 aa  74.7  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  22.61 
 
 		 1148 aa  74.7  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  26.27 
 
 		 1148 aa  74.3  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  25.24 
 
 		 1163 aa  73.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5486  TonB-dependent receptor plug  23.97 
 
 		 1147 aa  73.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.067232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  25.32 
 
 		 1217 aa  71.6  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  25.08 
 
 		 1114 aa  71.6  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 1144 aa  71.2  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0950  TonB-dependent receptor plug  25.99 
 
 		 1199 aa  70.5  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00543932  normal  0.368502 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 814 aa  70.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  22.93 
 
 		 1097 aa  70.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  24.32 
 
 		 1219 aa  70.5  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  21.64 
 
 		 1127 aa  70.1  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  26.43 
 
 		 1103 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  22.95 
 
 		 1177 aa  70.1  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1856  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 792 aa  69.3  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.693128  normal  0.812872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2373  hypothetical protein  25.41 
 
 		 619 aa  68.9  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.651768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  27.3 
 
 		 1132 aa  68.9  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 935 aa  68.6  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1606  hypothetical protein  25.76 
 
 		 802 aa  68.6  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00919182  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  24.24 
 
 		 1096 aa  68.6  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  23.06 
 
 		 1128 aa  68.6  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  24.71 
 
 		 1139 aa  68.6  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  23.32 
 
 		 1124 aa  68.6  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  20.71 
 
 		 897 aa  68.2  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  24.31 
 
 		 1169 aa  67.8  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  24.66 
 
 		 1192 aa  67.8  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  24.75 
 
 		 1122 aa  67.8  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  24.25 
 
 		 1142 aa  67.8  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2881  TonB-dependent receptor plug  26.74 
 
 		 1205 aa  67.8  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 1144 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  29.08 
 
 		 730 aa  66.6  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>