228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0274 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 791 aa  1610    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  43.04 
 
 		 814 aa  598  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  42.71 
 
 		 787 aa  598  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  40.74 
 
 		 775 aa  587  1e-166  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  39.5 
 
 		 793 aa  566  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  38.28 
 
 		 772 aa  545  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  37.33 
 
 		 775 aa  541  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  38.02 
 
 		 791 aa  533  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  36.62 
 
 		 872 aa  526  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  38.09 
 
 		 792 aa  520  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  36.78 
 
 		 780 aa  516  1.0000000000000001e-145  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  37.08 
 
 		 790 aa  513  1e-144  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  37.65 
 
 		 881 aa  502  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  36.51 
 
 		 800 aa  493  9.999999999999999e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  36.45 
 
 		 803 aa  461  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  33.38 
 
 		 923 aa  449  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  33.46 
 
 		 928 aa  450  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  33.46 
 
 		 923 aa  422  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  33.25 
 
 		 800 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  32.3 
 
 		 917 aa  411  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0030  TonB-dependent receptor plug  32.78 
 
 		 786 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  30.12 
 
 		 789 aa  347  6e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  30.68 
 
 		 875 aa  344  2.9999999999999997e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  29.85 
 
 		 874 aa  342  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  31.39 
 
 		 772 aa  341  2.9999999999999998e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 		 806 aa  336  7.999999999999999e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 		 804 aa  322  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0255  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 852 aa  318  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.786505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1696  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 756 aa  292  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  29.62 
 
 		 753 aa  280  9e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  24.41 
 
 		 888 aa  167  8e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  24.76 
 
 		 831 aa  160  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2316  hypothetical protein  25.23 
 
 		 866 aa  138  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.824305  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  22.35 
 
 		 906 aa  111  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 814 aa  103  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  21.69 
 
 		 859 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  20.98 
 
 		 777 aa  89  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  23.78 
 
 		 779 aa  87.4  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  21.91 
 
 		 865 aa  82  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  21.06 
 
 		 897 aa  78.6  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0118  TonB-dependent receptor, plug  26.59 
 
 		 821 aa  78.2  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1856  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 792 aa  77.4  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.693128  normal  0.812872 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  29.9 
 
 		 821 aa  75.1  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  26.32 
 
 		 771 aa  73.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  28.85 
 
 		 827 aa  72  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  20.77 
 
 		 859 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  20.74 
 
 		 860 aa  70.1  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  22.62 
 
 		 797 aa  68.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4145  TonB-dependent receptor  21.98 
 
 		 865 aa  68.6  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0626141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  29.46 
 
 		 1155 aa  67  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  27.82 
 
 		 1059 aa  65.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  26.85 
 
 		 1163 aa  65.1  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2533  TonB-dependent receptor  21.85 
 
 		 800 aa  63.9  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 1175 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 1020 aa  62.4  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 897 aa  62.4  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01505  putative TonB-dependent transmembrane receptor protein  25 
 
 		 803 aa  58.5  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  29.94 
 
 		 750 aa  58.5  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1234  TonB-dependent receptor plug  22.04 
 
 		 716 aa  58.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  25.5 
 
 		 975 aa  58.2  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  25.12 
 
 		 730 aa  57.8  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  30.63 
 
 		 1146 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  24.54 
 
 		 719 aa  57  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6166  TonB-dependent receptor plug  26.22 
 
 		 977 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679734  decreased coverage  0.00200292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  27.73 
 
 		 1036 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  24.4 
 
 		 767 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  25.56 
 
 		 747 aa  57  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 1105 aa  56.6  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  28.46 
 
 		 1025 aa  57  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  24.79 
 
 		 511 aa  55.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  26.01 
 
 		 1181 aa  55.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 1123 aa  55.5  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  24.56 
 
 		 1028 aa  55.1  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  27.01 
 
 		 1065 aa  54.7  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 833 aa  54.7  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 882 aa  54.7  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  27.9 
 
 		 1033 aa  54.7  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  25.63 
 
 		 1024 aa  54.3  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 		 962 aa  54.3  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  24.89 
 
 		 1106 aa  54.3  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  29.86 
 
 		 946 aa  54.3  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  30.98 
 
 		 1043 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  28.86 
 
 		 1080 aa  53.9  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  21.9 
 
 		 763 aa  53.9  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 1050 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 1114 aa  53.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  20.66 
 
 		 812 aa  53.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  28.79 
 
 		 1147 aa  52.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  25.9 
 
 		 1102 aa  53.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  25.71 
 
 		 1062 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  25.93 
 
 		 1132 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  25.44 
 
 		 772 aa  53.5  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  26.75 
 
 		 1064 aa  52.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  25.27 
 
 		 872 aa  52  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  24.51 
 
 		 1006 aa  52  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 1166 aa  51.6  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0522  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 727 aa  51.6  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.569695 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  26.5 
 
 		 1139 aa  52  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  27.4 
 
 		 1071 aa  52  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  27.73 
 
 		 1100 aa  51.6  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>