More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01250 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0066  TonB-dependent receptor  47.78 
 
 		 798 aa  719    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000206959  hitchhiker  0.0000000155765 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0064  TonB-dependent receptor  47.78 
 
 		 798 aa  719    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00224959  unclonable  0.0000416662 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3988  TonB-dependent receptor  47.52 
 
 		 798 aa  710    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000235152  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0068  TonB-dependent receptor  47.78 
 
 		 798 aa  719    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000121546  unclonable  0.000000000240632 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4286  TonB-dependent receptor  47.34 
 
 		 798 aa  716    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000018092  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0063  TonB-dependent receptor  47.72 
 
 		 798 aa  723    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0128619  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0068  TonB-dependent receptor  47.72 
 
 		 798 aa  723    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00237309  hitchhiker  0.00396946 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02415  TonB-dependent receptor  45.04 
 
 		 814 aa  667    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 882 aa  1773    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0067  outer membrane insertion C-terminal signal  47.59 
 
 		 798 aa  722    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00013463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3963  TonB-dependent receptor  37.47 
 
 		 812 aa  528  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000386767  normal  0.0993256 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02625  TonB-dependent receptor  38.2 
 
 		 836 aa  494  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107636  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3229  TonB-dependent receptor  34.93 
 
 		 875 aa  432  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  32.44 
 
 		 866 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1881  TonB-dependent receptor  33.9 
 
 		 838 aa  375  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.490789  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3961  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 835 aa  275  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0305  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 786 aa  265  3e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.301005 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04790  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 793 aa  260  7e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0241337  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4077  cyclic nucleotide-binding protein  26.17 
 
 		 959 aa  239  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3503  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 754 aa  233  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2959  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 761 aa  233  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.404716 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0977  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 757 aa  232  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1434  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 753 aa  227  6e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000294975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1822  TonB-dependent receptor, plug  27.26 
 
 		 756 aa  217  7e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000398859  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0143  TonB-dependent receptor plug  26.57 
 
 		 864 aa  201  6e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556848  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03378  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 798 aa  184  5.0000000000000004e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0156374  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0334  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 815 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000617894  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0866  TonB-dependent receptor  35.87 
 
 		 879 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.250778  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1484  TonB-dependent receptor plug  24.68 
 
 		 831 aa  166  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.135772  normal  0.425755 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3957  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 870 aa  157  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3280  TonB-dependent receptor  33.22 
 
 		 923 aa  128  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322049  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  27.59 
 
 		 808 aa  100  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  29.62 
 
 		 791 aa  94  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  27.95 
 
 		 788 aa  93.6  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  35.48 
 
 		 1094 aa  92.4  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  29.17 
 
 		 795 aa  92.4  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  27.55 
 
 		 809 aa  91.3  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0821  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 929 aa  90.1  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  26.81 
 
 		 753 aa  89.7  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1769  TonB-dependent receptor plug  31.44 
 
 		 1085 aa  88.2  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  27.04 
 
 		 810 aa  87.8  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 1046 aa  87  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  29.44 
 
 		 760 aa  87  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  29.62 
 
 		 1008 aa  87  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  29.46 
 
 		 1075 aa  86.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1487  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 958 aa  87  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4491  TonB-dependent receptor, plug  27.95 
 
 		 1129 aa  85.1  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  27.1 
 
 		 907 aa  83.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 828 aa  84  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  22.59 
 
 		 812 aa  84.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  25.77 
 
 		 747 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  26.82 
 
 		 1064 aa  82.8  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  28.52 
 
 		 1080 aa  82.8  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 1127 aa  83.2  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0816  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 816 aa  82.8  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  27.14 
 
 		 807 aa  82.4  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 893 aa  81.6  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  29.57 
 
 		 872 aa  80.5  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  23.71 
 
 		 914 aa  80.5  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 845 aa  80.5  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  29.92 
 
 		 1079 aa  80.9  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  25.89 
 
 		 806 aa  80.5  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  32.96 
 
 		 1004 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  27.27 
 
 		 799 aa  80.1  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  27.04 
 
 		 791 aa  80.1  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  26.12 
 
 		 769 aa  79.7  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  28 
 
 		 874 aa  79.7  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  26.19 
 
 		 809 aa  79.3  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  24.36 
 
 		 750 aa  79  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  25.28 
 
 		 1107 aa  79  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 798 aa  78.6  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1020 aa  78.6  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  30.04 
 
 		 1027 aa  78.2  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  31.65 
 
 		 1030 aa  78.2  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  34.3 
 
 		 1008 aa  77.8  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  37.88 
 
 		 1089 aa  77.4  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  28.09 
 
 		 1095 aa  77.4  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2445  TonB-dependent receptor plug  26.09 
 
 		 1094 aa  77.4  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 		 989 aa  76.6  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01815  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 927 aa  76.3  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12863  hypothetical protein  35.59 
 
 		 828 aa  75.9  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  34.08 
 
 		 1004 aa  75.9  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 735 aa  75.9  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  24.83 
 
 		 758 aa  75.1  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1601  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 1055 aa  75.1  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.709185 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  37.27 
 
 		 1066 aa  74.7  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  27.97 
 
 		 772 aa  74.7  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  32.54 
 
 		 1038 aa  75.1  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  27.01 
 
 		 1102 aa  75.1  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  25 
 
 		 942 aa  74.7  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  25.11 
 
 		 748 aa  74.3  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4523  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 		 998 aa  73.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0414328  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  25.25 
 
 		 824 aa  74.3  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  22.37 
 
 		 789 aa  73.9  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 818 aa  73.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 1020 aa  73.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  21.61 
 
 		 836 aa  73.2  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  28.96 
 
 		 1105 aa  72.8  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  26.16 
 
 		 785 aa  72.8  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  26.43 
 
 		 1181 aa  72.8  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>