136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2573 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  100 
 
 		 511 aa  1055    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  34.05 
 
 		 1176 aa  245  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  31.2 
 
 		 1194 aa  224  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  33.4 
 
 		 1232 aa  216  5.9999999999999996e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 1123 aa  212  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  30.6 
 
 		 1162 aa  205  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  35.09 
 
 		 1257 aa  195  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  36.14 
 
 		 1196 aa  189  7e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  29.54 
 
 		 1203 aa  187  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  41.03 
 
 		 1075 aa  186  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  35.16 
 
 		 1123 aa  186  7e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 1153 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  32.19 
 
 		 1210 aa  182  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  35.71 
 
 		 1105 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  31.2 
 
 		 1206 aa  180  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  34.47 
 
 		 1149 aa  178  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  33.22 
 
 		 1075 aa  177  6e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  30.33 
 
 		 1141 aa  176  6e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  31.7 
 
 		 1173 aa  176  9e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  34.01 
 
 		 1195 aa  172  9e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  34.08 
 
 		 1298 aa  171  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  34.02 
 
 		 1167 aa  168  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  34.71 
 
 		 1125 aa  167  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  33.73 
 
 		 1161 aa  162  9e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  33.8 
 
 		 1124 aa  159  9e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  33.54 
 
 		 1069 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  31.56 
 
 		 1065 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  32.38 
 
 		 1041 aa  150  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  31.81 
 
 		 986 aa  148  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  31.29 
 
 		 1114 aa  139  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  27.16 
 
 		 1162 aa  137  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  31.56 
 
 		 1122 aa  133  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 1105 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  30.26 
 
 		 1132 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  28.53 
 
 		 1008 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 1008 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  30.33 
 
 		 1066 aa  114  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  29.21 
 
 		 1010 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  30.82 
 
 		 1125 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  28.7 
 
 		 1071 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  27.83 
 
 		 1067 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  29.49 
 
 		 1068 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0900  hypothetical protein  28.15 
 
 		 1194 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  29.32 
 
 		 992 aa  104  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  28.09 
 
 		 1068 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  28.77 
 
 		 1056 aa  102  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  28.98 
 
 		 1074 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  27.02 
 
 		 1053 aa  99.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1126 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 1188 aa  97.4  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  25.79 
 
 		 1120 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  25.79 
 
 		 1122 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  25.9 
 
 		 979 aa  94.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  28.95 
 
 		 1012 aa  92.8  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  26.54 
 
 		 1081 aa  93.2  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  26.37 
 
 		 1052 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  28.61 
 
 		 1129 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  25.17 
 
 		 1066 aa  91.3  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  29.56 
 
 		 1077 aa  91.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  27.44 
 
 		 1057 aa  91.3  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 1026 aa  90.5  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  28.48 
 
 		 1105 aa  88.2  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 991 aa  88.2  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 		 1074 aa  87.8  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  24.48 
 
 		 966 aa  87.4  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  28.62 
 
 		 1007 aa  87  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 888 aa  86.7  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  27.22 
 
 		 1100 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  26.71 
 
 		 1109 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 1010 aa  85.1  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 1016 aa  84  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  28.28 
 
 		 1041 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1415  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 871 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810305  normal  0.0488884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  25.23 
 
 		 1097 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  24.78 
 
 		 994 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  27.92 
 
 		 1071 aa  79  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 1066 aa  77.4  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  24.5 
 
 		 997 aa  76.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 993 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  25.85 
 
 		 1054 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  24.07 
 
 		 1051 aa  72.4  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  26.49 
 
 		 972 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  26.95 
 
 		 1061 aa  69.7  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  23.4 
 
 		 1001 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 1089 aa  68.6  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  25.54 
 
 		 1050 aa  67.8  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  26.05 
 
 		 785 aa  67.4  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 1087 aa  67  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 897 aa  67  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 935 aa  66.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 966 aa  65.1  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  28.91 
 
 		 1066 aa  64.7  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  25.59 
 
 		 1007 aa  62.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1991  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 749 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  25.47 
 
 		 799 aa  58.9  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 791 aa  57  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  24.58 
 
 		 1116 aa  57.4  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  25.56 
 
 		 1008 aa  56.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 924 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  25.96 
 
 		 1147 aa  55.5  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>