294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3438 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 772 aa  1575    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  38.48 
 
 		 806 aa  520  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  37.75 
 
 		 789 aa  504  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  38.39 
 
 		 804 aa  500  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  37.2 
 
 		 874 aa  475  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  35.98 
 
 		 875 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  35.29 
 
 		 775 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  35.56 
 
 		 772 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  34.14 
 
 		 881 aa  439  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  34.24 
 
 		 775 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  33.85 
 
 		 793 aa  437  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  33.21 
 
 		 790 aa  437  1e-121  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  36.69 
 
 		 792 aa  432  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  34.98 
 
 		 814 aa  428  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  33.09 
 
 		 791 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  33.66 
 
 		 780 aa  410  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  33.82 
 
 		 787 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  32.61 
 
 		 800 aa  385  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0255  TonB-dependent receptor  31.59 
 
 		 852 aa  360  4e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.786505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  30.72 
 
 		 872 aa  357  5.999999999999999e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  30.58 
 
 		 923 aa  353  8.999999999999999e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  31.39 
 
 		 791 aa  341  2.9999999999999998e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 923 aa  333  5e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  30.86 
 
 		 928 aa  325  2e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  32.24 
 
 		 753 aa  324  3e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  30.54 
 
 		 917 aa  316  8e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  28.18 
 
 		 800 aa  308  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1696  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 756 aa  295  3e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  28.41 
 
 		 803 aa  281  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0030  TonB-dependent receptor plug  28.64 
 
 		 786 aa  280  7e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  28.61 
 
 		 831 aa  257  5e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  25.89 
 
 		 888 aa  211  4e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2316  hypothetical protein  24.52 
 
 		 866 aa  151  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.824305  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  23.42 
 
 		 859 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  23.6 
 
 		 777 aa  128  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  24.37 
 
 		 791 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  24.25 
 
 		 771 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4145  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 865 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0626141 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  22.61 
 
 		 906 aa  114  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  24.71 
 
 		 779 aa  113  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2533  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 800 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  23.59 
 
 		 822 aa  113  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  23.53 
 
 		 865 aa  104  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  23.59 
 
 		 797 aa  101  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  20.85 
 
 		 860 aa  95.1  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  27.68 
 
 		 767 aa  92.8  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  21.04 
 
 		 859 aa  92  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  21.33 
 
 		 897 aa  90.9  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  21.63 
 
 		 902 aa  87.4  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0287  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  21.28 
 
 		 714 aa  87  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000460019  hitchhiker  0.00000346512 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  28.47 
 
 		 821 aa  82.4  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1606  hypothetical protein  22.91 
 
 		 802 aa  81.3  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00919182  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 814 aa  77.4  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0684  putative TonB-dependent receptor  21.58 
 
 		 701 aa  76.3  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.507206  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  31.51 
 
 		 986 aa  74.3  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 897 aa  73.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 924 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  31.4 
 
 		 1062 aa  70.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  29.78 
 
 		 1051 aa  70.1  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 935 aa  68.9  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0118  TonB-dependent receptor, plug  25.71 
 
 		 821 aa  67.8  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 1155 aa  67.4  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  29.96 
 
 		 1114 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 1050 aa  66.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1023 aa  65.5  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  22.85 
 
 		 719 aa  65.1  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  20.44 
 
 		 888 aa  65.1  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  22.18 
 
 		 1087 aa  64.7  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1856  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 792 aa  62.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.693128  normal  0.812872 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  29.92 
 
 		 1056 aa  62  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  30.84 
 
 		 1148 aa  61.2  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  31.3 
 
 		 1146 aa  61.6  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  24.9 
 
 		 827 aa  61.2  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  28.9 
 
 		 1038 aa  61.2  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 1059 aa  61.2  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6166  TonB-dependent receptor plug  29.63 
 
 		 977 aa  61.2  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679734  decreased coverage  0.00200292 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  28.88 
 
 		 1066 aa  60.8  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0595  putative outer membrane receptor signal peptide protein  22.77 
 
 		 729 aa  60.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.426057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 1177 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4255  TonB-dependent receptor, plug  31.36 
 
 		 1034 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0522  TonB-dependent receptor  22.32 
 
 		 727 aa  60.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.569695 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0783  TonB-dependent receptor  20.12 
 
 		 708 aa  60.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.285032  normal  0.0256294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 982 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  30.89 
 
 		 1051 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  28.69 
 
 		 1021 aa  59.3  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 933 aa  58.9  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  29.27 
 
 		 999 aa  58.5  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  28.52 
 
 		 1063 aa  58.9  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0509  TonB-dependent receptor  21.94 
 
 		 743 aa  58.9  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.368087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4491  TonB-dependent receptor, plug  27.83 
 
 		 1129 aa  58.2  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  28.76 
 
 		 1006 aa  58.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  25.86 
 
 		 962 aa  58.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  27.75 
 
 		 1013 aa  58.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  25.9 
 
 		 1115 aa  58.2  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  27.8 
 
 		 1059 aa  58.2  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  28.25 
 
 		 1106 aa  57.8  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 1114 aa  57.8  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 966 aa  57.8  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  26.61 
 
 		 1043 aa  57.4  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2245  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 1040 aa  57.4  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>