137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5348 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  45.09 
 
 		 998 aa  772    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  100 
 
 		 946 aa  1920    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  34.16 
 
 		 961 aa  523  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  33.78 
 
 		 965 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  31.4 
 
 		 929 aa  419  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  30.65 
 
 		 921 aa  378  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  30.03 
 
 		 952 aa  350  7e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  28.28 
 
 		 930 aa  319  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  28.84 
 
 		 924 aa  317  8e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  29.63 
 
 		 887 aa  310  6.999999999999999e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  27.42 
 
 		 847 aa  281  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  27.3 
 
 		 920 aa  277  8e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2458  hypothetical protein  25.75 
 
 		 908 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  26.29 
 
 		 904 aa  265  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  26.61 
 
 		 929 aa  243  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  24.32 
 
 		 926 aa  213  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  32.04 
 
 		 944 aa  164  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1397  hypothetical protein  36.6 
 
 		 995 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2796  hypothetical protein  23.51 
 
 		 936 aa  142  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  32.11 
 
 		 895 aa  136  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6640  hypothetical protein  29.6 
 
 		 946 aa  134  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  33.21 
 
 		 826 aa  128  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  32.56 
 
 		 829 aa  124  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  26.38 
 
 		 915 aa  122  3.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 822 aa  114  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 973 aa  108  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  31.36 
 
 		 934 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 869 aa  105  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 852 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  29.63 
 
 		 853 aa  100  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 817 aa  98.2  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_002950  PG0441  hypothetical protein  28.23 
 
 		 877 aa  98.2  7e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  28.09 
 
 		 812 aa  97.8  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 832 aa  93.6  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 830 aa  92.8  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 806 aa  92.4  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 802 aa  92  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 824 aa  92  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 819 aa  89.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 821 aa  89  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 810 aa  88.2  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  23.92 
 
 		 804 aa  87.8  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  26.43 
 
 		 766 aa  87.8  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  30.62 
 
 		 813 aa  87.4  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  30.92 
 
 		 817 aa  87  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 818 aa  87  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  26 
 
 		 800 aa  85.1  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 813 aa  84.3  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  27.19 
 
 		 823 aa  84  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 847 aa  84  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  24.29 
 
 		 805 aa  82.4  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  24.41 
 
 		 815 aa  82  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  25.79 
 
 		 828 aa  81.6  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  28.35 
 
 		 816 aa  80.9  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 813 aa  80.1  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 820 aa  80.1  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  27.85 
 
 		 894 aa  79.3  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 827 aa  79.7  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  24.5 
 
 		 810 aa  79  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  25.6 
 
 		 872 aa  78.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 		 814 aa  78.2  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  28.45 
 
 		 814 aa  77.8  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1654  hypothetical protein  25.54 
 
 		 879 aa  76.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 808 aa  76.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 791 aa  74.7  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  24.6 
 
 		 805 aa  73.9  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  26.45 
 
 		 818 aa  73.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  26.56 
 
 		 891 aa  68.9  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 812 aa  67.4  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 866 aa  63.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  24.9 
 
 		 799 aa  60.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 946 aa  61.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 798 aa  58.5  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 805 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 795 aa  56.6  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  22.79 
 
 		 760 aa  55.8  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  24.54 
 
 		 772 aa  55.5  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 791 aa  54.7  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  25.48 
 
 		 820 aa  54.7  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  23.53 
 
 		 962 aa  54.3  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  23.6 
 
 		 791 aa  54.3  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 791 aa  54.3  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  23.41 
 
 		 932 aa  54.3  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 866 aa  53.5  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  22.75 
 
 		 803 aa  53.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 1001 aa  53.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 1075 aa  52.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 787 aa  51.6  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  31.71 
 
 		 952 aa  51.6  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 760 aa  51.6  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  27.18 
 
 		 775 aa  51.2  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  25.73 
 
 		 809 aa  51.2  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1938  TonB-dependent receptor  19.61 
 
 		 801 aa  50.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 836 aa  50.4  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  29.41 
 
 		 808 aa  50.8  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1414  hypothetical protein  33 
 
 		 871 aa  50.1  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.530363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 944 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  23.53 
 
 		 788 aa  50.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3000  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 854 aa  50.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.249213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 924 aa  50.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>