148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1136 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 998 aa  2006    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  45.99 
 
 		 946 aa  793    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  39.34 
 
 		 961 aa  614  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  34.8 
 
 		 965 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  33.33 
 
 		 929 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  33.2 
 
 		 921 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  33.47 
 
 		 952 aa  446  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  31.33 
 
 		 930 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  31.12 
 
 		 924 aa  375  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  28.97 
 
 		 920 aa  350  8e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  30.49 
 
 		 847 aa  347  6e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  29.07 
 
 		 887 aa  337  7e-91  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  28.07 
 
 		 904 aa  335  2e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  27.52 
 
 		 929 aa  300  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2458  hypothetical protein  28.67 
 
 		 908 aa  300  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2796  hypothetical protein  27.22 
 
 		 936 aa  241  6.999999999999999e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  38.82 
 
 		 926 aa  187  7e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  32.54 
 
 		 944 aa  179  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  33.22 
 
 		 872 aa  164  8.000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1397  hypothetical protein  37.09 
 
 		 995 aa  160  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243953 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  31.11 
 
 		 895 aa  148  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6640  hypothetical protein  30 
 
 		 946 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  33.06 
 
 		 829 aa  129  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  25.94 
 
 		 915 aa  128  5e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  35.05 
 
 		 826 aa  123  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  29.53 
 
 		 812 aa  121  7.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  34.07 
 
 		 813 aa  117  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 832 aa  115  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  33.03 
 
 		 869 aa  114  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 934 aa  112  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 802 aa  111  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  31.48 
 
 		 853 aa  110  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 852 aa  109  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  32.6 
 
 		 813 aa  108  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  28.67 
 
 		 766 aa  108  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  30.7 
 
 		 973 aa  108  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 827 aa  106  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 822 aa  105  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  32.62 
 
 		 817 aa  105  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 824 aa  103  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  30.85 
 
 		 818 aa  102  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  29.72 
 
 		 800 aa  102  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 821 aa  101  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 830 aa  100  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  31.02 
 
 		 810 aa  99.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  26.36 
 
 		 804 aa  98.6  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_002950  PG0441  hypothetical protein  27.68 
 
 		 877 aa  97.1  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  30.61 
 
 		 805 aa  96.3  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  28.09 
 
 		 805 aa  94.7  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 817 aa  93.2  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 820 aa  92.8  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  30.89 
 
 		 814 aa  90.9  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  32.03 
 
 		 806 aa  90.1  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 791 aa  89.4  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  27.71 
 
 		 815 aa  89  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  29.79 
 
 		 814 aa  89  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  27.53 
 
 		 823 aa  86.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  27.73 
 
 		 828 aa  86.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 847 aa  85.1  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1654  hypothetical protein  24.52 
 
 		 879 aa  84.7  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 		 818 aa  84.7  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 813 aa  84.3  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  30.05 
 
 		 891 aa  83.6  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  28.35 
 
 		 816 aa  81.6  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 808 aa  80.1  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 819 aa  79.7  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 866 aa  77  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  26.84 
 
 		 894 aa  74.7  0.000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  28.34 
 
 		 799 aa  72.4  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  23.2 
 
 		 810 aa  68.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 812 aa  68.9  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  26.38 
 
 		 820 aa  68.6  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 803 aa  68.2  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3000  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 854 aa  67  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.249213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 883 aa  65.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  26.89 
 
 		 772 aa  63.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 798 aa  62.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 805 aa  62.4  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0796  hypothetical protein  29.81 
 
 		 772 aa  60.5  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1015  tonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 750 aa  60.1  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 866 aa  60.1  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  25.79 
 
 		 932 aa  58.9  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 759 aa  58.2  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1075 aa  57.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  23.29 
 
 		 782 aa  56.6  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25.28 
 
 		 715 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 924 aa  55.8  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  32.54 
 
 		 808 aa  55.1  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  24.22 
 
 		 931 aa  54.7  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 962 aa  53.9  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 917 aa  53.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  27.17 
 
 		 748 aa  52.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 1004 aa  52.4  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  27.91 
 
 		 725 aa  52.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  28.05 
 
 		 1036 aa  52.4  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1720  TonB-dependent receptor plug  24.46 
 
 		 760 aa  52  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  26.89 
 
 		 962 aa  52  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  31.13 
 
 		 793 aa  51.6  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  28.18 
 
 		 872 aa  51.6  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 833 aa  50.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>