83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0241 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  44.06 
 
 		 920 aa  712    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  100 
 
 		 929 aa  1877    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  32.97 
 
 		 924 aa  400  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  29.26 
 
 		 904 aa  311  5e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  28.68 
 
 		 961 aa  307  7e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 998 aa  305  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  27.45 
 
 		 929 aa  279  1e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  26.61 
 
 		 946 aa  270  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  28.06 
 
 		 887 aa  268  2.9999999999999995e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  27.87 
 
 		 952 aa  248  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  26.35 
 
 		 965 aa  243  9e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  26.59 
 
 		 921 aa  235  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  26.79 
 
 		 930 aa  233  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  25.61 
 
 		 847 aa  223  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2458  hypothetical protein  27.01 
 
 		 908 aa  206  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  25.46 
 
 		 944 aa  185  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  24.08 
 
 		 872 aa  177  8e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  23.86 
 
 		 926 aa  152  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2796  hypothetical protein  24.51 
 
 		 936 aa  147  8.000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  32.28 
 
 		 895 aa  143  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6640  hypothetical protein  27.99 
 
 		 946 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  29.28 
 
 		 915 aa  127  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  27.43 
 
 		 891 aa  97.1  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1397  hypothetical protein  26.81 
 
 		 995 aa  94.7  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243953 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 822 aa  91.7  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1654  hypothetical protein  26.75 
 
 		 879 aa  90.1  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  30.57 
 
 		 826 aa  87  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_002950  PG0441  hypothetical protein  24.25 
 
 		 877 aa  86.7  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 808 aa  86.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 847 aa  83.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  25.18 
 
 		 815 aa  75.5  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  26.49 
 
 		 805 aa  73.9  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 766 aa  72.8  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 813 aa  72.8  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 803 aa  71.6  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 818 aa  70.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  24.73 
 
 		 818 aa  69.3  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  30.23 
 
 		 804 aa  69.3  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 829 aa  68.9  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  24.09 
 
 		 814 aa  66.6  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 973 aa  66.6  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  26.32 
 
 		 805 aa  65.5  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  26.97 
 
 		 800 aa  65.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 852 aa  65.5  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 869 aa  65.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 802 aa  65.1  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  27.01 
 
 		 814 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 		 763 aa  63.9  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  24.21 
 
 		 820 aa  64.3  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  22.31 
 
 		 810 aa  64.3  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 824 aa  62  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 832 aa  61.2  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  23.22 
 
 		 821 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  25.58 
 
 		 853 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  22.69 
 
 		 866 aa  58.9  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 830 aa  58.9  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  21.71 
 
 		 813 aa  58.9  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 934 aa  58.5  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  25.98 
 
 		 799 aa  58.5  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 820 aa  58.2  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 813 aa  58.2  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 962 aa  57.4  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  22.43 
 
 		 828 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  23.68 
 
 		 897 aa  56.2  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 827 aa  55.1  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 946 aa  53.5  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  24.32 
 
 		 806 aa  53.5  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  21.55 
 
 		 938 aa  52.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  24.4 
 
 		 894 aa  52.8  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  30.23 
 
 		 1094 aa  50.8  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 817 aa  50.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  24.57 
 
 		 810 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 793 aa  50.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  25.67 
 
 		 823 aa  48.5  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 791 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  28.93 
 
 		 719 aa  47  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  30.63 
 
 		 838 aa  46.2  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  28.08 
 
 		 914 aa  45.8  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 819 aa  45.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  21.63 
 
 		 972 aa  45.4  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 795 aa  45.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  24.19 
 
 		 788 aa  45.1  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2467  CinA domain protein  27.34 
 
 		 172 aa  45.1  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>