154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5599 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 866 aa  1772    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  38.89 
 
 		 824 aa  535  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  31.69 
 
 		 828 aa  363  5.0000000000000005e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 826 aa  349  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  31.35 
 
 		 830 aa  345  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 808 aa  286  8e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  28.67 
 
 		 805 aa  279  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 820 aa  265  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 810 aa  263  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 791 aa  262  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  28.6 
 
 		 815 aa  260  7e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 821 aa  259  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  30.96 
 
 		 829 aa  255  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 822 aa  254  7e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 817 aa  251  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 818 aa  248  3e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 827 aa  236  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 812 aa  234  6e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 817 aa  226  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 847 aa  225  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 813 aa  225  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  27.63 
 
 		 800 aa  224  6e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 803 aa  221  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  27.62 
 
 		 818 aa  219  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 852 aa  217  7e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  26.64 
 
 		 853 aa  213  9e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 934 aa  213  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 973 aa  210  7e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  25.38 
 
 		 766 aa  209  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 802 aa  208  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 869 aa  207  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 883 aa  205  4e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  27 
 
 		 805 aa  204  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  26.29 
 
 		 804 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 812 aa  188  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 705 aa  186  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 813 aa  186  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  29.01 
 
 		 814 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 819 aa  180  9e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 813 aa  180  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 611 aa  179  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  26.7 
 
 		 799 aa  176  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 832 aa  175  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  24.65 
 
 		 816 aa  174  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  24.66 
 
 		 820 aa  167  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  27.53 
 
 		 725 aa  165  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 795 aa  162  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25.03 
 
 		 715 aa  161  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 793 aa  159  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  26.36 
 
 		 810 aa  154  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  25.03 
 
 		 897 aa  154  7e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  24.66 
 
 		 894 aa  151  7e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 805 aa  147  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  24.37 
 
 		 709 aa  147  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 794 aa  140  7.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  33.19 
 
 		 814 aa  108  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 748 aa  107  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  29.87 
 
 		 823 aa  102  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0796  hypothetical protein  23.53 
 
 		 772 aa  93.2  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  30.74 
 
 		 806 aa  92.8  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 998 aa  76.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  23.86 
 
 		 961 aa  71.2  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4518  TonB-dependent receptor  21.09 
 
 		 705 aa  70.5  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  26.23 
 
 		 952 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  24.07 
 
 		 965 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  27.03 
 
 		 847 aa  67.8  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  21.89 
 
 		 920 aa  66.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  24.25 
 
 		 924 aa  66.2  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  25.11 
 
 		 944 aa  65.1  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  25.1 
 
 		 921 aa  63.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  24.8 
 
 		 946 aa  63.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  24 
 
 		 926 aa  62.4  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  25 
 
 		 887 aa  61.6  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  27.12 
 
 		 915 aa  60.5  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 763 aa  58.9  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  23.84 
 
 		 930 aa  58.9  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  21.77 
 
 		 929 aa  57.4  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  23.92 
 
 		 904 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2840  TonB-dependent siderophore receptor  25.99 
 
 		 849 aa  55.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000068938  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  25.1 
 
 		 895 aa  56.2  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0313  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 897 aa  54.7  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  23.86 
 
 		 929 aa  54.7  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  22.31 
 
 		 872 aa  53.9  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  23.27 
 
 		 920 aa  52.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 917 aa  52.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  26.01 
 
 		 1082 aa  52.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  26.27 
 
 		 989 aa  52.4  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  26.16 
 
 		 760 aa  52  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  26.92 
 
 		 1138 aa  51.2  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2438  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 892 aa  50.8  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.615124  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  22.36 
 
 		 891 aa  50.1  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  22.5 
 
 		 836 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  24.58 
 
 		 747 aa  50.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 		 1119 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 1063 aa  49.7  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 938 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5364  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 729 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 901 aa  48.9  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1968  TonB-dependent heme receptor  28 
 
 		 690 aa  48.9  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  25.4 
 
 		 1023 aa  48.1  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>