89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0796 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0796  hypothetical protein  100 
 
 		 772 aa  1590    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 817 aa  146  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  25.16 
 
 		 820 aa  143  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  27.19 
 
 		 805 aa  133  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  27.07 
 
 		 816 aa  132  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 		 827 aa  131  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 847 aa  129  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  22.89 
 
 		 820 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  22.42 
 
 		 799 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 795 aa  117  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 813 aa  113  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  22.16 
 
 		 813 aa  106  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 810 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4518  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 705 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 973 aa  105  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 829 aa  101  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 869 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 822 aa  98.2  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 866 aa  96.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 805 aa  95.5  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  24.4 
 
 		 725 aa  94.4  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  22.91 
 
 		 883 aa  94  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  23.06 
 
 		 818 aa  93.6  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  21.33 
 
 		 808 aa  94  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  30.4 
 
 		 806 aa  91.3  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 791 aa  90.5  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 705 aa  86.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 802 aa  84.7  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  24.17 
 
 		 897 aa  84.3  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 852 aa  84.3  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  22.82 
 
 		 821 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 748 aa  80.9  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  21.18 
 
 		 818 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  24.77 
 
 		 814 aa  79  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 611 aa  78.6  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  22.6 
 
 		 812 aa  78.6  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  23.96 
 
 		 805 aa  77.8  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 817 aa  76.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  27.12 
 
 		 782 aa  76.6  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  23.32 
 
 		 766 aa  74.7  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  22.74 
 
 		 853 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  24.51 
 
 		 709 aa  73.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 803 aa  68.9  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 934 aa  68.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  21.62 
 
 		 832 aa  67  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 813 aa  65.1  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 998 aa  61.6  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  28.86 
 
 		 804 aa  60.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  21.55 
 
 		 794 aa  60.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 824 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  22.65 
 
 		 815 aa  58.5  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  30.25 
 
 		 924 aa  58.2  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  23.62 
 
 		 828 aa  57.8  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  27.27 
 
 		 952 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 800 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03327  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 862 aa  53.5  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  25.44 
 
 		 1074 aa  54.3  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  27.52 
 
 		 920 aa  53.9  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  24.6 
 
 		 926 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  23.04 
 
 		 932 aa  53.5  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 830 aa  52.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  21.57 
 
 		 894 aa  51.6  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 793 aa  51.6  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 957 aa  50.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  31.67 
 
 		 808 aa  50.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  26.48 
 
 		 1046 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  30.89 
 
 		 791 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 917 aa  48.9  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0185  ragA protein  24.9 
 
 		 1017 aa  48.1  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.458513 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3424  TonB-dependent receptor  32.88 
 
 		 815 aa  48.1  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.053865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  25.93 
 
 		 946 aa  47.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  27.94 
 
 		 1008 aa  47  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 826 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  27.46 
 
 		 891 aa  47.4  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1405  TonB-dependent receptor, plug  29.22 
 
 		 993 aa  47  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00000855387  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 901 aa  47.4  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  25.82 
 
 		 979 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  26.32 
 
 		 914 aa  46.2  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  22.78 
 
 		 1023 aa  47  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  26.91 
 
 		 823 aa  47  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5203  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 1004 aa  45.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00178942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  31.34 
 
 		 944 aa  45.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  25.73 
 
 		 1164 aa  45.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  27.19 
 
 		 810 aa  45.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  23.17 
 
 		 930 aa  45.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 757 aa  44.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  23.75 
 
 		 1003 aa  44.7  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  24.28 
 
 		 1116 aa  44.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  23.98 
 
 		 1188 aa  44.3  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>