229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3654 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  60.97 
 
 
819 aa  1015    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 
810 aa  1649    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  42.38 
 
 
715 aa  556  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  33.04 
 
 
813 aa  343  5e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 
817 aa  324  3e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 
812 aa  310  5.9999999999999995e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 
829 aa  306  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 
802 aa  300  6e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  30.8 
 
 
869 aa  284  6.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  29.47 
 
 
894 aa  279  2e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  29.27 
 
 
853 aa  266  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 
934 aa  265  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 
852 aa  253  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 
973 aa  244  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  29.85 
 
 
812 aa  243  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 
832 aa  243  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  27.84 
 
 
766 aa  233  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 
818 aa  219  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 
820 aa  218  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 
847 aa  212  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 
830 aa  211  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 
810 aa  206  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  26.55 
 
 
805 aa  200  9e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  26.56 
 
 
815 aa  199  1.0000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 
822 aa  192  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  29 
 
 
817 aa  189  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 
808 aa  189  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  25.24 
 
 
805 aa  185  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 
821 aa  184  8.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 
824 aa  180  8e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  26.61 
 
 
804 aa  176  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  23.18 
 
 
806 aa  174  6.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 
814 aa  172  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 
813 aa  171  4e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 
791 aa  171  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 
827 aa  167  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 
805 aa  163  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 
705 aa  159  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 
866 aa  159  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  22.74 
 
 
816 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  25.53 
 
 
725 aa  154  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 
803 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  23.2 
 
 
800 aa  144  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  25.29 
 
 
897 aa  143  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  23.18 
 
 
828 aa  141  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  25.22 
 
 
820 aa  141  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  23.13 
 
 
793 aa  137  6.0000000000000005e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 
794 aa  134  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 
883 aa  130  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  25.35 
 
 
799 aa  127  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  31.25 
 
 
818 aa  124  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 
826 aa  118  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  25.33 
 
 
709 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 
611 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  36.24 
 
 
823 aa  114  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 
748 aa  110  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 
795 aa  102  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 
813 aa  100  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 
814 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  24.81 
 
 
946 aa  80.9  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  23.88 
 
 
961 aa  71.6  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4518  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 
705 aa  70.1  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  24.82 
 
 
926 aa  68.6  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_002950  PG0441  hypothetical protein  26.97 
 
 
877 aa  67.8  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 
998 aa  67.4  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  26.44 
 
 
965 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  28.46 
 
 
760 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 
1004 aa  64.3  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  25.76 
 
 
924 aa  63.5  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  25.5 
 
 
929 aa  63.9  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  25.59 
 
 
952 aa  63.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  20.31 
 
 
930 aa  63.9  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  26.19 
 
 
833 aa  62.8  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  26.76 
 
 
944 aa  63.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  23.44 
 
 
921 aa  62.4  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  28.35 
 
 
739 aa  60.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 
938 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  26.11 
 
 
904 aa  59.3  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  26.75 
 
 
748 aa  58.9  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  26.88 
 
 
753 aa  58.9  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  25.87 
 
 
782 aa  58.2  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 
920 aa  58.2  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  23.53 
 
 
744 aa  57.8  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  24.72 
 
 
746 aa  57.4  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  26.14 
 
 
931 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  23.79 
 
 
744 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  25.93 
 
 
747 aa  56.6  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2840  TonB-dependent siderophore receptor  32.85 
 
 
849 aa  55.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000068938  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1485  outer membrane receptor FepA  21.94 
 
 
777 aa  55.8  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0839984  normal  0.152216 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  27.8 
 
 
848 aa  55.1  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  26.75 
 
 
1060 aa  54.3  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2402  TonB-dependent receptor, plug  43.75 
 
 
724 aa  54.3  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000227129  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  24.28 
 
 
744 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  32.23 
 
 
648 aa  53.5  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0312  iron(III) dicitrate transport protein, outer membrane receptor  22.29 
 
 
807 aa  53.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.670307  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0802  TonB-dependent siderophore receptor  21.84 
 
 
764 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37010  outer membrane receptor FepA  30.12 
 
 
757 aa  53.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0110447  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 
974 aa  53.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  22.61 
 
 
838 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2889  outer membrane receptor FepA  28.93 
 
 
724 aa  52.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>