120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3169 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 813 aa  1668    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  36.36 
 
 		 827 aa  478  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  36.59 
 
 		 820 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  35.53 
 
 		 817 aa  435  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  33.09 
 
 		 805 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  32.65 
 
 		 847 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  34.42 
 
 		 816 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  30.41 
 
 		 814 aa  353  8.999999999999999e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 818 aa  343  5.999999999999999e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 813 aa  299  1e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  29.88 
 
 		 725 aa  288  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  28.41 
 
 		 897 aa  280  6e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  28.35 
 
 		 820 aa  277  6e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  29.57 
 
 		 709 aa  273  8.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 805 aa  273  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 611 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 799 aa  265  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 808 aa  252  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  27.14 
 
 		 805 aa  246  9e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 705 aa  246  9e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  26.35 
 
 		 806 aa  244  3.9999999999999997e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 821 aa  242  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 826 aa  237  8e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 802 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 794 aa  234  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 883 aa  231  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 793 aa  225  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 830 aa  223  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 795 aa  220  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 810 aa  220  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 869 aa  218  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 817 aa  218  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 822 aa  218  4e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  24.51 
 
 		 766 aa  208  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 824 aa  206  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 813 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 852 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  25.33 
 
 		 815 aa  197  5.000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 791 aa  189  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 829 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 866 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  24.85 
 
 		 800 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 832 aa  180  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 973 aa  179  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 934 aa  172  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 803 aa  171  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  23.36 
 
 		 894 aa  158  4e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 819 aa  156  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  24.91 
 
 		 828 aa  147  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  23.46 
 
 		 715 aa  144  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  32.06 
 
 		 804 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 748 aa  134  9e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  31.28 
 
 		 853 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  35.95 
 
 		 818 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  28.74 
 
 		 812 aa  125  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  25.16 
 
 		 823 aa  117  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  33.18 
 
 		 814 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  32.6 
 
 		 998 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  32.18 
 
 		 812 aa  107  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0796  hypothetical protein  22.24 
 
 		 772 aa  104  6e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4518  TonB-dependent receptor  21.82 
 
 		 705 aa  100  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  25.9 
 
 		 810 aa  94  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  29.48 
 
 		 961 aa  93.2  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  30.12 
 
 		 946 aa  84.3  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  28.47 
 
 		 965 aa  81.3  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  26.41 
 
 		 952 aa  81.3  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  23.96 
 
 		 887 aa  80.5  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  21.2 
 
 		 782 aa  77.4  0.0000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  27.48 
 
 		 924 aa  76.3  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  26.55 
 
 		 929 aa  73.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  22.55 
 
 		 930 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2458  hypothetical protein  28.06 
 
 		 908 aa  69.3  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  25 
 
 		 921 aa  65.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  24.54 
 
 		 920 aa  64.3  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  24.15 
 
 		 926 aa  63.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  32.3 
 
 		 866 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 920 aa  58.9  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  25 
 
 		 904 aa  58.5  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  23.79 
 
 		 895 aa  58.2  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1397  hypothetical protein  23.33 
 
 		 995 aa  56.6  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  24.19 
 
 		 944 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  28.48 
 
 		 847 aa  56.2  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  27.65 
 
 		 797 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  25.18 
 
 		 748 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  28.7 
 
 		 1074 aa  54.3  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  25.71 
 
 		 791 aa  52  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  31.8 
 
 		 893 aa  51.6  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0441  hypothetical protein  23.58 
 
 		 877 aa  51.2  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  26.19 
 
 		 838 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 935 aa  51.6  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 933 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  21.9 
 
 		 891 aa  50.1  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  25.24 
 
 		 919 aa  49.7  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2796  hypothetical protein  23.29 
 
 		 936 aa  50.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0251  hypothetical protein  22.75 
 
 		 692 aa  49.7  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.614508  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6640  hypothetical protein  24.09 
 
 		 946 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  31.52 
 
 		 747 aa  49.3  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  21.71 
 
 		 929 aa  48.9  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 946 aa  48.9  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 833 aa  48.5  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>