152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6217 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 820 aa  1694    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  43.23 
 
 		 827 aa  671    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  42.08 
 
 		 817 aa  593  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  39.9 
 
 		 847 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  36.61 
 
 		 816 aa  484  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  37.35 
 
 		 805 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  36.59 
 
 		 813 aa  469  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  34.41 
 
 		 814 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  33.61 
 
 		 818 aa  422  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 805 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  37.82 
 
 		 611 aa  388  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  32.25 
 
 		 813 aa  372  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  31.4 
 
 		 709 aa  362  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  30.62 
 
 		 897 aa  348  2e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  31.66 
 
 		 808 aa  347  5e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  29.79 
 
 		 806 aa  346  8e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 810 aa  345  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  31.83 
 
 		 821 aa  345  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  32.55 
 
 		 705 aa  331  3e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 883 aa  321  3e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 818 aa  321  3.9999999999999996e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  30.61 
 
 		 725 aa  313  5.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  29.48 
 
 		 805 aa  310  5e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 799 aa  308  4.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 794 aa  307  6e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 820 aa  306  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  30.57 
 
 		 824 aa  302  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 826 aa  298  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  28.69 
 
 		 815 aa  293  1e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 822 aa  292  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 793 aa  286  1.0000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 795 aa  285  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 802 aa  281  5e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 866 aa  265  4e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  28.37 
 
 		 766 aa  262  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 869 aa  261  5.0000000000000005e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  28.92 
 
 		 800 aa  258  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 829 aa  249  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  27.45 
 
 		 828 aa  245  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 813 aa  245  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 973 aa  239  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  28.34 
 
 		 812 aa  238  4e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 791 aa  229  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 934 aa  228  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 803 aa  226  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 852 aa  226  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 832 aa  223  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  26.05 
 
 		 853 aa  219  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 		 804 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 817 aa  214  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 819 aa  207  5e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 812 aa  205  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  25.4 
 
 		 810 aa  203  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 748 aa  185  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  35.28 
 
 		 830 aa  182  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  24.05 
 
 		 894 aa  179  2e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  24.93 
 
 		 814 aa  172  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  24.6 
 
 		 715 aa  162  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  25.96 
 
 		 823 aa  157  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4518  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 705 aa  133  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  22.41 
 
 		 782 aa  127  7e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0796  hypothetical protein  23.11 
 
 		 772 aa  118  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 998 aa  94  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  28.98 
 
 		 961 aa  93.6  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  25.09 
 
 		 926 aa  88.6  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  26.59 
 
 		 952 aa  86.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  23.53 
 
 		 887 aa  83.2  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  25.29 
 
 		 946 aa  80.1  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  25.73 
 
 		 929 aa  75.9  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  27.34 
 
 		 915 aa  75.5  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  24.51 
 
 		 965 aa  74.3  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  25.62 
 
 		 930 aa  73.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  24.7 
 
 		 921 aa  72.8  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  27.69 
 
 		 891 aa  70.5  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  25.28 
 
 		 924 aa  67.4  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  25 
 
 		 920 aa  65.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  24.15 
 
 		 944 aa  65.1  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2458  hypothetical protein  25.81 
 
 		 908 aa  61.2  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 893 aa  60.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  28.72 
 
 		 904 aa  60.1  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  23.14 
 
 		 929 aa  58.2  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  25.58 
 
 		 872 aa  57.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  25.65 
 
 		 769 aa  57.8  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  21.27 
 
 		 895 aa  57.4  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  28.57 
 
 		 847 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 859 aa  57  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  22.88 
 
 		 817 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4071  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 792 aa  57  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 920 aa  55.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 946 aa  54.3  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  24.51 
 
 		 808 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  25.08 
 
 		 748 aa  53.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 938 aa  52.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  23.2 
 
 		 808 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  23.17 
 
 		 817 aa  52  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  22.98 
 
 		 1089 aa  52  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 917 aa  51.6  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 798 aa  51.2  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  26.29 
 
 		 1147 aa  50.8  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  23.19 
 
 		 933 aa  50.8  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>