91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1880 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  44.11 
 
 		 929 aa  712    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  100 
 
 		 920 aa  1847    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  34.12 
 
 		 924 aa  463  1e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 998 aa  352  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  30.15 
 
 		 961 aa  334  6e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  29.61 
 
 		 965 aa  309  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  28.87 
 
 		 904 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  28.51 
 
 		 887 aa  304  4.0000000000000003e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  29.16 
 
 		 930 aa  301  5e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  27.16 
 
 		 946 aa  299  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  28.01 
 
 		 929 aa  286  2.0000000000000002e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  27.22 
 
 		 847 aa  256  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  27.93 
 
 		 921 aa  254  5.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  27.12 
 
 		 952 aa  242  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  27.49 
 
 		 926 aa  228  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2458  hypothetical protein  26.2 
 
 		 908 aa  207  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  32.89 
 
 		 915 aa  144  5e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  31.25 
 
 		 895 aa  139  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  29.89 
 
 		 872 aa  133  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1397  hypothetical protein  33.8 
 
 		 995 aa  109  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  24.39 
 
 		 766 aa  98.6  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2796  hypothetical protein  31.69 
 
 		 936 aa  97.8  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 822 aa  96.3  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  25.09 
 
 		 891 aa  95.5  4e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  24.44 
 
 		 815 aa  90.5  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 829 aa  85.9  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 869 aa  83.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_002950  PG0441  hypothetical protein  22.7 
 
 		 877 aa  82.4  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 817 aa  76.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 808 aa  76.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 847 aa  76.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1654  hypothetical protein  23.14 
 
 		 879 aa  76.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  24.45 
 
 		 814 aa  75.5  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 826 aa  75.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 830 aa  75.5  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 810 aa  75.1  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 824 aa  73.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 813 aa  73.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  26.32 
 
 		 805 aa  72.8  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  25.42 
 
 		 805 aa  72.8  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 934 aa  72.8  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 803 aa  71.6  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  21.74 
 
 		 828 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 802 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  27.7 
 
 		 804 aa  70.1  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 818 aa  70.1  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 852 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 973 aa  68.9  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  26.46 
 
 		 853 aa  68.9  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  24.89 
 
 		 806 aa  68.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  24.14 
 
 		 820 aa  68.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 820 aa  68.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  26.91 
 
 		 800 aa  68.6  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 813 aa  67.8  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  24.91 
 
 		 812 aa  66.6  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 		 821 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  21.97 
 
 		 866 aa  66.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 946 aa  66.2  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  27.64 
 
 		 894 aa  64.3  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  27.3 
 
 		 814 aa  63.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  22.88 
 
 		 799 aa  63.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 805 aa  62.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  24.38 
 
 		 818 aa  62  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 832 aa  60.1  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  22.3 
 
 		 823 aa  59.3  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 817 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 812 aa  58.9  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  21.52 
 
 		 813 aa  57.8  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0796  hypothetical protein  27.27 
 
 		 772 aa  56.2  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  22.96 
 
 		 791 aa  55.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 705 aa  55.1  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 795 aa  52.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  25.33 
 
 		 833 aa  52.4  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  20.78 
 
 		 827 aa  51.6  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  26.21 
 
 		 715 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  23.18 
 
 		 944 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1720  TonB-dependent receptor plug  25.98 
 
 		 760 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  23.27 
 
 		 991 aa  48.5  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 962 aa  48.1  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  27.67 
 
 		 1075 aa  48.1  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  31.97 
 
 		 854 aa  47.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 855 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  22.67 
 
 		 883 aa  47.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 794 aa  47  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  24.69 
 
 		 725 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1015  tonB-dependent receptor  22 
 
 		 750 aa  45.8  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 748 aa  45.1  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  22.22 
 
 		 810 aa  44.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  23.7 
 
 		 897 aa  44.7  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5660  hypothetical protein  32 
 
 		 588 aa  44.3  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 791 aa  44.3  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>