241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5304 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 812 aa  1671    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  41.54 
 
 		 817 aa  610  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  40.27 
 
 		 813 aa  553  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  33.89 
 
 		 802 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  33.58 
 
 		 973 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  32.12 
 
 		 829 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  32.02 
 
 		 832 aa  349  9e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  32.31 
 
 		 869 aa  348  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  30.89 
 
 		 934 aa  336  9e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  32.58 
 
 		 812 aa  330  7e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 852 aa  321  3e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  28.69 
 
 		 810 aa  304  5.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 819 aa  303  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 821 aa  260  6e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 810 aa  250  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 824 aa  246  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 808 aa  244  3.9999999999999997e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 830 aa  243  7.999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  28.97 
 
 		 715 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 826 aa  233  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 818 aa  231  6e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 791 aa  223  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  26.23 
 
 		 766 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 822 aa  220  8.999999999999998e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  27.33 
 
 		 894 aa  213  1e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  25.03 
 
 		 828 aa  210  8e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 803 aa  207  6e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 820 aa  206  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 813 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 847 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  24.32 
 
 		 805 aa  194  5e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  25.52 
 
 		 815 aa  191  4e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 866 aa  189  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  48.06 
 
 		 853 aa  187  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  25.98 
 
 		 805 aa  184  6e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 817 aa  184  8.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 705 aa  182  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 827 aa  176  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  26.69 
 
 		 816 aa  172  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  25.26 
 
 		 823 aa  164  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  23.19 
 
 		 814 aa  154  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  22.68 
 
 		 818 aa  154  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 793 aa  148  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  23.35 
 
 		 800 aa  142  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  25.4 
 
 		 799 aa  141  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  35.32 
 
 		 804 aa  138  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 611 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  24.74 
 
 		 725 aa  127  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  22.46 
 
 		 795 aa  114  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  33.65 
 
 		 897 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  31.98 
 
 		 813 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  32.43 
 
 		 814 aa  102  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  25.49 
 
 		 709 aa  101  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  29.15 
 
 		 820 aa  100  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  31.55 
 
 		 805 aa  94.7  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  31.88 
 
 		 806 aa  89.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 748 aa  85.1  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 883 aa  79  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4518  TonB-dependent receptor  22.79 
 
 		 705 aa  78.6  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 794 aa  72.4  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  26.58 
 
 		 961 aa  72  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 998 aa  72  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  26.62 
 
 		 946 aa  67.4  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  25.53 
 
 		 929 aa  65.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  27.73 
 
 		 965 aa  65.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  22.42 
 
 		 926 aa  63.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  30.91 
 
 		 681 aa  63.5  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  27.95 
 
 		 782 aa  62.4  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  27.22 
 
 		 952 aa  61.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  24.16 
 
 		 930 aa  60.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  27.53 
 
 		 924 aa  60.1  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2646  TonB-dependent receptor plug  21.41 
 
 		 790 aa  60.5  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  27.22 
 
 		 904 aa  59.7  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  26.88 
 
 		 920 aa  58.9  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  28.69 
 
 		 1060 aa  58.5  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1839  outer membrane receptor FepA  30.19 
 
 		 703 aa  57.8  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  22.17 
 
 		 921 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37010  outer membrane receptor FepA  30.3 
 
 		 757 aa  57.4  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0110447  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 933 aa  56.6  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  24.19 
 
 		 944 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4504  TonB-dependent receptor plug  24.81 
 
 		 1074 aa  54.7  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342548  normal  0.477441 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  30.26 
 
 		 663 aa  54.3  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 663 aa  54.3  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  30.26 
 
 		 659 aa  54.3  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  30.3 
 
 		 746 aa  54.3  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  30.26 
 
 		 663 aa  54.3  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  30.26 
 
 		 663 aa  54.3  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  30.26 
 
 		 663 aa  54.3  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  30.26 
 
 		 663 aa  54.3  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  23.32 
 
 		 887 aa  53.5  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1450  outer membrane receptor FepA  28.93 
 
 		 740 aa  54.3  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  30.2 
 
 		 641 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0950  TonB-dependent receptor plug  27.46 
 
 		 1199 aa  53.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00543932  normal  0.368502 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2972  outer membrane receptor FepA  28.57 
 
 		 724 aa  53.5  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0370731 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2889  outer membrane receptor FepA  29.08 
 
 		 724 aa  52.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  30.32 
 
 		 746 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3075  outer membrane receptor FepA  29.08 
 
 		 724 aa  52.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2953  outer membrane receptor FepA  29.08 
 
 		 724 aa  52.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246738  hitchhiker  0.000000000736095 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2919  outer membrane receptor FepA  29.08 
 
 		 724 aa  52.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91274  normal  0.0854265 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3743  outer membrane receptor FepA  30.61 
 
 		 766 aa  52.4  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.325826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>