More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0332 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  50.68 
 
 		 832 aa  773    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  64.84 
 
 		 829 aa  1041    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  53.82 
 
 		 973 aa  802    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  55.74 
 
 		 852 aa  900    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  54.42 
 
 		 934 aa  846    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 869 aa  1748    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  55.63 
 
 		 853 aa  869    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  35.59 
 
 		 802 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  37.27 
 
 		 812 aa  422  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  35.99 
 
 		 813 aa  403  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  33.58 
 
 		 817 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  32.31 
 
 		 812 aa  350  6e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  28.94 
 
 		 766 aa  293  8e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 830 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 810 aa  283  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  30.9 
 
 		 810 aa  275  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 820 aa  260  7e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 826 aa  259  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 808 aa  255  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 821 aa  250  7e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 819 aa  248  4.9999999999999997e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  27.04 
 
 		 805 aa  244  6e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 827 aa  238  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  26.63 
 
 		 894 aa  237  7e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  25.7 
 
 		 815 aa  231  5e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 791 aa  228  3e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 818 aa  224  6e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  28.31 
 
 		 804 aa  221  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 813 aa  218  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 824 aa  217  9e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  27.23 
 
 		 805 aa  209  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 803 aa  209  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  29 
 
 		 823 aa  207  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  25.95 
 
 		 828 aa  206  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 866 aa  205  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 817 aa  204  8e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 847 aa  202  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  42.91 
 
 		 822 aa  194  8e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  26.6 
 
 		 715 aa  193  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  29.59 
 
 		 814 aa  191  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  24.61 
 
 		 818 aa  191  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 705 aa  180  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  27.56 
 
 		 897 aa  179  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  25.93 
 
 		 806 aa  179  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  24.23 
 
 		 820 aa  177  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  24.57 
 
 		 814 aa  177  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  25.58 
 
 		 800 aa  174  9e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 793 aa  157  8e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 795 aa  155  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  25.09 
 
 		 799 aa  146  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  38.8 
 
 		 813 aa  143  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 725 aa  140  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 794 aa  140  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 883 aa  138  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 		 805 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  23.88 
 
 		 709 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  33.03 
 
 		 998 aa  112  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  30.8 
 
 		 946 aa  105  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  31.98 
 
 		 961 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 611 aa  103  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 748 aa  102  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  28.57 
 
 		 887 aa  92.8  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  26.02 
 
 		 816 aa  93.2  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  31.67 
 
 		 965 aa  92.8  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0796  hypothetical protein  24.44 
 
 		 772 aa  93.6  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  31.74 
 
 		 924 aa  92  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  27.13 
 
 		 920 aa  83.2  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  27.44 
 
 		 904 aa  80.9  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  26.39 
 
 		 926 aa  80.1  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  26.8 
 
 		 952 aa  79  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0089  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 957 aa  77  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 931 aa  77  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4518  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 705 aa  76.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  23.18 
 
 		 930 aa  74.7  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2458  hypothetical protein  28.83 
 
 		 908 aa  74.3  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 962 aa  72.8  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  26.77 
 
 		 872 aa  71.2  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  27.75 
 
 		 760 aa  69.3  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  28.33 
 
 		 944 aa  68.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  25.1 
 
 		 921 aa  68.2  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  26.96 
 
 		 848 aa  66.2  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  27.84 
 
 		 891 aa  65.1  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  31.35 
 
 		 929 aa  64.3  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  33.33 
 
 		 847 aa  63.9  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  27.35 
 
 		 833 aa  63.2  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  25.41 
 
 		 782 aa  62.8  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 946 aa  62.8  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  31.05 
 
 		 1014 aa  62  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  23.9 
 
 		 746 aa  62.4  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  29.79 
 
 		 1060 aa  61.2  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2445  TonB-dependent receptor plug  32.31 
 
 		 1094 aa  61.2  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  41.05 
 
 		 797 aa  61.2  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 1004 aa  60.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 933 aa  59.7  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  28.5 
 
 		 747 aa  58.9  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 763 aa  58.9  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 897 aa  58.9  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4687  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 682 aa  58.9  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  21.83 
 
 		 929 aa  58.5  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 991 aa  58.5  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>