227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1455 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  47.11 
 
 		 823 aa  730    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 814 aa  1658    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 808 aa  265  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 821 aa  262  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 810 aa  249  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 829 aa  234  5e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 822 aa  210  9e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 830 aa  207  7e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 852 aa  204  4e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 832 aa  201  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 824 aa  200  7.999999999999999e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  27.41 
 
 		 805 aa  198  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 869 aa  197  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 802 aa  195  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 791 aa  195  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  25.09 
 
 		 800 aa  192  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 973 aa  191  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  27.94 
 
 		 853 aa  190  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  27.58 
 
 		 812 aa  189  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 818 aa  189  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  25.63 
 
 		 815 aa  187  9e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 820 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 827 aa  174  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 817 aa  167  8e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  25.45 
 
 		 805 aa  165  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 934 aa  164  9e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  23.28 
 
 		 766 aa  159  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 803 aa  157  8e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  38.96 
 
 		 813 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  22.64 
 
 		 812 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 847 aa  151  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  25.12 
 
 		 828 aa  146  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  38.06 
 
 		 817 aa  146  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  38.36 
 
 		 826 aa  145  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 705 aa  145  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  25.53 
 
 		 816 aa  138  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  25.71 
 
 		 894 aa  136  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  23.71 
 
 		 818 aa  130  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  23.43 
 
 		 814 aa  128  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  23.57 
 
 		 810 aa  126  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  25.22 
 
 		 799 aa  126  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  23.51 
 
 		 806 aa  120  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  22.49 
 
 		 715 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  33.18 
 
 		 813 aa  116  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  23.07 
 
 		 897 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  32.47 
 
 		 866 aa  107  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  32.23 
 
 		 813 aa  103  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  22.72 
 
 		 795 aa  102  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  28.38 
 
 		 804 aa  101  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  22.65 
 
 		 820 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  31.06 
 
 		 961 aa  97.8  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 793 aa  95.5  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  22.78 
 
 		 805 aa  95.1  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  23.75 
 
 		 725 aa  90.9  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 998 aa  89.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 794 aa  89  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 611 aa  88.2  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 883 aa  86.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  25.93 
 
 		 709 aa  82.4  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 819 aa  80.9  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  28.73 
 
 		 944 aa  79  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  25.96 
 
 		 926 aa  79.3  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  28.45 
 
 		 946 aa  77.8  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  28.36 
 
 		 904 aa  77.4  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  23.73 
 
 		 930 aa  76.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  25.97 
 
 		 887 aa  76.3  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 748 aa  76.6  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  29.54 
 
 		 965 aa  75.5  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  27.43 
 
 		 929 aa  72.4  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  26.09 
 
 		 915 aa  69.3  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 943 aa  68.6  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  26.72 
 
 		 872 aa  65.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  26.96 
 
 		 929 aa  66.2  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  23.77 
 
 		 920 aa  65.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  25.55 
 
 		 895 aa  64.3  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  24.48 
 
 		 986 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  26.14 
 
 		 748 aa  63.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  26.99 
 
 		 921 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3000  TonB-dependent receptor  32.12 
 
 		 854 aa  60.8  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.249213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 1063 aa  60.1  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  24.39 
 
 		 924 aa  59.7  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 833 aa  58.9  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  27.47 
 
 		 952 aa  58.9  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  26.88 
 
 		 1019 aa  58.9  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  26.79 
 
 		 1050 aa  57.8  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  24.09 
 
 		 782 aa  57  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  25.89 
 
 		 979 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 893 aa  57.4  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  25.1 
 
 		 833 aa  56.2  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 1050 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4944  hypothetical protein  32.23 
 
 		 381 aa  56.2  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  25.08 
 
 		 914 aa  55.5  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  29.66 
 
 		 847 aa  55.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1769  TonB-dependent receptor plug  24.8 
 
 		 1085 aa  55.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  25.37 
 
 		 931 aa  55.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  30.41 
 
 		 1124 aa  55.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  26.57 
 
 		 681 aa  54.3  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  38.89 
 
 		 663 aa  54.3  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  38.89 
 
 		 663 aa  54.3  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  38.89 
 
 		 641 aa  54.3  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>