205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5882 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  100 
 
 
826 aa  1694    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  36.33 
 
 
824 aa  460  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  34.66 
 
 
830 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 
866 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 
821 aa  353  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  31.71 
 
 
808 aa  343  9e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  31.33 
 
 
810 aa  332  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  29.05 
 
 
828 aa  331  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 
822 aa  318  4e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 
820 aa  308  4.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 
818 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  28.72 
 
 
766 aa  291  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 
829 aa  287  5e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  28.06 
 
 
805 aa  283  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  30.17 
 
 
812 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  26.28 
 
 
815 aa  275  3e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 
827 aa  274  6e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 
813 aa  273  9e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 
802 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 
869 aa  266  8e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 
832 aa  263  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 
847 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  28.71 
 
 
853 aa  253  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 
791 aa  251  4e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 
852 aa  251  5e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 
812 aa  246  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 
973 aa  246  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 
817 aa  246  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 
817 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 
803 aa  242  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 
813 aa  242  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  26.55 
 
 
818 aa  236  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 
804 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 
934 aa  223  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 
819 aa  220  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  27.84 
 
 
814 aa  214  4.9999999999999996e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  26.18 
 
 
805 aa  203  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  25.88 
 
 
800 aa  201  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  25.58 
 
 
810 aa  197  7e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  26.78 
 
 
725 aa  195  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 
813 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 
883 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 
795 aa  184  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  26.55 
 
 
709 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  25.95 
 
 
897 aa  174  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  24.32 
 
 
820 aa  169  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 
794 aa  166  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 
611 aa  160  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 
805 aa  159  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  25.5 
 
 
799 aa  158  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25.67 
 
 
715 aa  157  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  22.94 
 
 
894 aa  152  3e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  23.82 
 
 
806 aa  149  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  38.5 
 
 
814 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  35.23 
 
 
961 aa  142  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  32.75 
 
 
946 aa  131  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 
748 aa  128  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 
998 aa  127  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  32.57 
 
 
823 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  31.52 
 
 
816 aa  118  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 
793 aa  111  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  31.22 
 
 
952 aa  99.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  30.52 
 
 
921 aa  94.4  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  28.7 
 
 
904 aa  90.1  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  31.9 
 
 
929 aa  89  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  38.14 
 
 
705 aa  86.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  26.36 
 
 
887 aa  85.5  0.000000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  26.03 
 
 
926 aa  84.3  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2458  hypothetical protein  30.94 
 
 
908 aa  82  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  29.29 
 
 
915 aa  81.3  0.00000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  25.76 
 
 
944 aa  81.3  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  26.89 
 
 
965 aa  80.9  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4518  TonB-dependent receptor  22.61 
 
 
705 aa  78.6  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  28.4 
 
 
920 aa  75.5  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0796  hypothetical protein  22.78 
 
 
772 aa  73.9  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  27.02 
 
 
924 aa  73.6  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  33.56 
 
 
847 aa  72.8  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  28.9 
 
 
895 aa  70.5  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  24.48 
 
 
929 aa  67.4  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  24.16 
 
 
747 aa  65.1  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 
1089 aa  63.9  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2796  hypothetical protein  28.98 
 
 
936 aa  63.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  22.97 
 
 
748 aa  62  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  26.39 
 
 
817 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 
917 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 
920 aa  59.3  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  25.33 
 
 
931 aa  58.5  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  25.2 
 
 
760 aa  58.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00302  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 
746 aa  57.8  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0777336  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0441  hypothetical protein  24.54 
 
 
877 aa  57.4  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0089  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 
957 aa  55.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 
972 aa  55.8  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 
933 aa  55.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1397  hypothetical protein  24.31 
 
 
995 aa  55.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0243953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4146  TonB-dependent receptor  31.08 
 
 
961 aa  55.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960595  normal  0.432652 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4071  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 
792 aa  55.1  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3260  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 
739 aa  55.1  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  25 
 
 
991 aa  54.7  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 
962 aa  54.3  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 
924 aa  54.3  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>