129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1515 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 705 aa  1435    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  33.96 
 
 		 827 aa  353  5e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  32.37 
 
 		 847 aa  340  4e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  32.55 
 
 		 820 aa  331  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  33.19 
 
 		 817 aa  298  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 813 aa  288  2.9999999999999996e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  31.56 
 
 		 805 aa  274  5.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  30.27 
 
 		 816 aa  271  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 830 aa  267  4e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  28.78 
 
 		 818 aa  260  6e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  32.18 
 
 		 795 aa  254  5.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 813 aa  246  8e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  26.69 
 
 		 725 aa  246  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 810 aa  244  6e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 611 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 808 aa  229  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  28.94 
 
 		 814 aa  228  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  27.6 
 
 		 709 aa  226  8e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 897 aa  225  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 883 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  25.94 
 
 		 806 aa  221  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 818 aa  221  5e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 822 aa  219  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 821 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 		 820 aa  216  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 794 aa  214  3.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 805 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  27.26 
 
 		 815 aa  213  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  27 
 
 		 799 aa  210  7e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 832 aa  206  8e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  27.54 
 
 		 805 aa  205  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  24.49 
 
 		 766 aa  196  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 802 aa  195  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 973 aa  195  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 824 aa  195  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 793 aa  191  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  29.03 
 
 		 812 aa  188  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 866 aa  186  9e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 817 aa  184  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 812 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  26.31 
 
 		 800 aa  182  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 829 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 869 aa  181  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 791 aa  181  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 934 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 748 aa  171  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 852 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 803 aa  167  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  26.74 
 
 		 810 aa  157  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  24.42 
 
 		 715 aa  150  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  25.27 
 
 		 853 aa  145  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  24.28 
 
 		 814 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 819 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  22.81 
 
 		 894 aa  127  1e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  23.18 
 
 		 828 aa  124  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4518  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 705 aa  117  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  39.29 
 
 		 813 aa  113  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  33.87 
 
 		 804 aa  105  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  35.77 
 
 		 823 aa  88.2  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  38.14 
 
 		 826 aa  86.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  25.04 
 
 		 782 aa  85.5  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0796  hypothetical protein  23.54 
 
 		 772 aa  84.3  0.000000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  25 
 
 		 921 aa  65.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 920 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  25.47 
 
 		 952 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 917 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  32.82 
 
 		 946 aa  57.8  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 842 aa  57.4  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  28.81 
 
 		 961 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  27.44 
 
 		 920 aa  55.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4146  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 961 aa  54.7  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960595  normal  0.432652 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  21.16 
 
 		 926 aa  53.5  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01762  hypothetical protein  27.45 
 
 		 714 aa  52.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  30.11 
 
 		 924 aa  52.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 931 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  22 
 
 		 887 aa  52.4  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  26.92 
 
 		 686 aa  52  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  33.06 
 
 		 919 aa  52.4  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03327  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 862 aa  52  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 938 aa  52  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 918 aa  51.6  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  29.63 
 
 		 680 aa  51.6  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  21.09 
 
 		 634 aa  51.6  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  28.11 
 
 		 706 aa  51.2  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  24.87 
 
 		 838 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4821  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 621 aa  51.2  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  22.24 
 
 		 897 aa  50.8  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2735  TonB-dependent receptor, plug  27.78 
 
 		 650 aa  49.7  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3125  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 785 aa  49.7  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1655  TonB-dependent siderophore receptor  23.5 
 
 		 656 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 945 aa  49.3  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2840  TonB-dependent siderophore receptor  26.54 
 
 		 849 aa  48.9  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000068938  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  30.92 
 
 		 678 aa  48.9  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0094  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 649 aa  48.9  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  26.2 
 
 		 847 aa  48.9  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1175  TonB-dependent siderophore receptor  23.67 
 
 		 749 aa  48.5  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0089  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 957 aa  48.5  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2276  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 751 aa  48.5  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  27.74 
 
 		 681 aa  48.5  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  23.61 
 
 		 932 aa  48.5  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>