75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4088 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  100 
 
 		 847 aa  1746    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  32.81 
 
 		 961 aa  420  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 998 aa  348  3e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  30.5 
 
 		 929 aa  339  9.999999999999999e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  30.26 
 
 		 965 aa  310  9e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  27.42 
 
 		 946 aa  281  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  28.49 
 
 		 952 aa  272  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  30.16 
 
 		 930 aa  271  4e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  27.54 
 
 		 921 aa  266  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  27.36 
 
 		 924 aa  244  6e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  27.1 
 
 		 920 aa  242  2.9999999999999997e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  26.82 
 
 		 887 aa  237  6e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  25.61 
 
 		 929 aa  205  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2458  hypothetical protein  27.49 
 
 		 908 aa  194  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  25.15 
 
 		 926 aa  187  7e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  27.09 
 
 		 904 aa  182  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  26.51 
 
 		 944 aa  180  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2796  hypothetical protein  24.85 
 
 		 936 aa  165  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  44.38 
 
 		 872 aa  144  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1397  hypothetical protein  42.68 
 
 		 995 aa  135  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6640  hypothetical protein  44 
 
 		 946 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  29.61 
 
 		 895 aa  121  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  40.3 
 
 		 915 aa  112  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  26.84 
 
 		 891 aa  101  6e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_002950  PG0441  hypothetical protein  30.65 
 
 		 877 aa  83.6  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1654  hypothetical protein  33.33 
 
 		 879 aa  81.6  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  29.65 
 
 		 715 aa  78.2  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  33.56 
 
 		 826 aa  73.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  30.91 
 
 		 725 aa  73.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  34 
 
 		 822 aa  71.2  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  32.32 
 
 		 853 aa  69.3  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 866 aa  68.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  31.33 
 
 		 804 aa  65.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 810 aa  65.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 869 aa  65.1  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 817 aa  64.7  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 832 aa  64.3  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 852 aa  64.3  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  29.93 
 
 		 806 aa  64.3  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 829 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 813 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  26.67 
 
 		 805 aa  62  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 802 aa  62  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  33.99 
 
 		 805 aa  62  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  34.27 
 
 		 973 aa  61.2  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 821 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 934 aa  60.1  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  24.28 
 
 		 766 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 830 aa  59.7  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 808 aa  59.3  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  25.31 
 
 		 828 aa  58.5  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  31.43 
 
 		 812 aa  58.9  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  28.26 
 
 		 823 aa  58.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 824 aa  57.8  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 818 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 820 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  25.14 
 
 		 815 aa  56.6  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 813 aa  56.2  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  25.45 
 
 		 894 aa  55.5  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  29.66 
 
 		 814 aa  55.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  20.9 
 
 		 847 aa  54.3  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 819 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  24.71 
 
 		 897 aa  50.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  22.79 
 
 		 813 aa  50.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 818 aa  49.7  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 800 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 817 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0621  TonB-dependent receptor plug  23.98 
 
 		 713 aa  48.9  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 705 aa  48.9  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  24.04 
 
 		 814 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  26.53 
 
 		 810 aa  46.2  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 791 aa  45.8  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  27.16 
 
 		 820 aa  45.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 812 aa  45.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  25.95 
 
 		 799 aa  44.3  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>