49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6640 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6640  hypothetical protein  100 
 
 		 946 aa  1940    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  32.61 
 
 		 944 aa  478  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  37.83 
 
 		 904 aa  159  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  24.62 
 
 		 952 aa  158  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  33.68 
 
 		 961 aa  157  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  29.6 
 
 		 946 aa  149  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  21.92 
 
 		 929 aa  147  8.000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  31.37 
 
 		 924 aa  143  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  44 
 
 		 847 aa  143  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  31.89 
 
 		 921 aa  142  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  30.55 
 
 		 998 aa  136  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  23.72 
 
 		 965 aa  134  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  25.21 
 
 		 887 aa  126  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  28.27 
 
 		 929 aa  125  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  29.87 
 
 		 930 aa  124  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  30.77 
 
 		 915 aa  116  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  29.63 
 
 		 895 aa  115  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2458  hypothetical protein  27.27 
 
 		 908 aa  114  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  29.36 
 
 		 872 aa  110  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_002950  PG0441  hypothetical protein  31.18 
 
 		 877 aa  86.3  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2796  hypothetical protein  27.13 
 
 		 936 aa  82.4  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1397  hypothetical protein  25.2 
 
 		 995 aa  80.1  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243953 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 813 aa  73.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1654  hypothetical protein  30.94 
 
 		 879 aa  71.6  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  24.69 
 
 		 891 aa  68.9  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 822 aa  65.1  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  28.46 
 
 		 804 aa  64.7  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 		 847 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 818 aa  61.2  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 791 aa  56.6  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 826 aa  56.2  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 820 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  25.86 
 
 		 805 aa  54.7  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 866 aa  53.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 813 aa  52.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  25.09 
 
 		 816 aa  52.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  23.14 
 
 		 818 aa  52  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  25.76 
 
 		 806 aa  51.2  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  24.71 
 
 		 894 aa  50.4  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  24.78 
 
 		 814 aa  50.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  24.31 
 
 		 920 aa  49.3  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 817 aa  49.3  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 824 aa  49.3  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  23.11 
 
 		 829 aa  48.9  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  23.08 
 
 		 815 aa  47.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 813 aa  46.2  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  21.6 
 
 		 821 aa  45.8  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 817 aa  45.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  23.9 
 
 		 810 aa  45.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>