More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5164 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  100 
 
 
813 aa  1660    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  46.02 
 
 
817 aa  719    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  40.61 
 
 
812 aa  552  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  38.68 
 
 
802 aa  500  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  36.39 
 
 
829 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  38.6 
 
 
934 aa  440  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  37 
 
 
853 aa  432  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  36.54 
 
 
973 aa  429  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  36.51 
 
 
812 aa  420  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  35.89 
 
 
852 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  35.99 
 
 
869 aa  403  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  32.97 
 
 
832 aa  379  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  32.88 
 
 
810 aa  335  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 
821 aa  320  7.999999999999999e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  29.28 
 
 
766 aa  311  2.9999999999999997e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 
810 aa  301  4e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 
819 aa  299  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 
808 aa  285  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  29.45 
 
 
894 aa  284  5.000000000000001e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 
822 aa  277  6e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 
824 aa  273  7e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 
830 aa  273  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  31.54 
 
 
715 aa  270  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  27.6 
 
 
815 aa  266  1e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 
826 aa  255  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 
818 aa  247  8e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 
827 aa  247  8e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 
820 aa  245  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  25.82 
 
 
805 aa  242  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 
791 aa  241  5e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  28.09 
 
 
828 aa  240  5.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  28.17 
 
 
804 aa  239  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 
817 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  27.57 
 
 
818 aa  228  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 
847 aa  227  6e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 
866 aa  224  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 
813 aa  220  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  27.42 
 
 
814 aa  219  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  27.38 
 
 
805 aa  205  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 
816 aa  204  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 
813 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 
803 aa  203  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 
805 aa  188  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 
795 aa  183  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 
611 aa  174  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 
883 aa  172  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 
793 aa  165  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  26.54 
 
 
820 aa  163  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  24.22 
 
 
800 aa  161  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  26.34 
 
 
725 aa  157  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  41.44 
 
 
823 aa  156  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  25.98 
 
 
799 aa  155  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  38.96 
 
 
814 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  22.25 
 
 
794 aa  145  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  34.56 
 
 
897 aa  118  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  33.63 
 
 
998 aa  117  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  24.02 
 
 
709 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  39.29 
 
 
705 aa  113  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  31.76 
 
 
961 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 
748 aa  105  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  23.91 
 
 
872 aa  96.3  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  30.62 
 
 
946 aa  87.4  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  27.69 
 
 
782 aa  85.9  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  28.25 
 
 
806 aa  86.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  30.12 
 
 
924 aa  84.7  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  31.2 
 
 
965 aa  84  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  29.9 
 
 
904 aa  83.2  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  31.52 
 
 
952 aa  83.2  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  31.22 
 
 
887 aa  81.6  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  30.28 
 
 
929 aa  81.3  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 
931 aa  77  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  28.06 
 
 
921 aa  77  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  27.1 
 
 
944 aa  75.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4518  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 
705 aa  72.8  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  26.91 
 
 
930 aa  72  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  24.77 
 
 
926 aa  70.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1397  hypothetical protein  26.69 
 
 
995 aa  70.5  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0243953 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  30.94 
 
 
1014 aa  69.7  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  34.92 
 
 
779 aa  68.6  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  28.19 
 
 
920 aa  67.8  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0089  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 
957 aa  67  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 
763 aa  66.2  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  26.32 
 
 
915 aa  64.7  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  26.09 
 
 
895 aa  64.7  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0796  hypothetical protein  26.12 
 
 
772 aa  64.7  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0441  hypothetical protein  28.57 
 
 
877 aa  64.3  0.000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  27.08 
 
 
1147 aa  64.3  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 
938 aa  64.3  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  26.55 
 
 
1066 aa  63.9  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 
1004 aa  63.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  26.85 
 
 
902 aa  63.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  26.94 
 
 
1075 aa  63.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  29.89 
 
 
847 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  27.65 
 
 
769 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  26.94 
 
 
918 aa  62.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2445  TonB-dependent receptor plug  26.41 
 
 
1094 aa  62  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01815  TonB-dependent receptor  28 
 
 
927 aa  62  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 
1148 aa  61.2  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  28.7 
 
 
962 aa  61.2  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  25 
 
 
920 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>