115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0733 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  100 
 
 		 904 aa  1834    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  31.48 
 
 		 961 aa  331  5.0000000000000004e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 998 aa  322  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  29.07 
 
 		 929 aa  311  2e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  28.33 
 
 		 924 aa  296  1e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  28.32 
 
 		 920 aa  289  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  26.76 
 
 		 946 aa  283  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  28.62 
 
 		 952 aa  265  4e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  26.87 
 
 		 921 aa  257  7e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  27.18 
 
 		 965 aa  242  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  26.16 
 
 		 930 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  25.57 
 
 		 929 aa  224  6e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  26.8 
 
 		 926 aa  210  9e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  25.21 
 
 		 944 aa  203  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  27.09 
 
 		 847 aa  195  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2458  hypothetical protein  25.55 
 
 		 908 aa  194  9e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  25.94 
 
 		 887 aa  189  3e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  23.57 
 
 		 872 aa  162  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6640  hypothetical protein  35.58 
 
 		 946 aa  160  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  32.07 
 
 		 895 aa  127  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  28.25 
 
 		 915 aa  125  5e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2796  hypothetical protein  33.58 
 
 		 936 aa  114  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1397  hypothetical protein  31.48 
 
 		 995 aa  112  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243953 
 
 
-
 
NC_002950  PG0441  hypothetical protein  26.76 
 
 		 877 aa  103  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 829 aa  102  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  21.98 
 
 		 817 aa  99.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 847 aa  95.1  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 826 aa  94.7  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 813 aa  92.4  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 822 aa  92  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1654  hypothetical protein  28.98 
 
 		 879 aa  90.1  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 818 aa  90.1  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 832 aa  89.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 853 aa  89.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  27.37 
 
 		 891 aa  89  4e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 821 aa  87.8  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  29.18 
 
 		 804 aa  85.9  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 		 812 aa  85.5  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 973 aa  85.5  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  26.82 
 
 		 805 aa  84  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 869 aa  84  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  27.85 
 
 		 814 aa  83.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  29.2 
 
 		 800 aa  83.2  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 852 aa  82.8  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 824 aa  82.4  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 830 aa  82  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  21.76 
 
 		 813 aa  80.5  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 934 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 808 aa  79.3  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 791 aa  78.6  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 803 aa  78.6  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  26.58 
 
 		 799 aa  77.8  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 828 aa  76.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 802 aa  76.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 766 aa  77  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 810 aa  75.1  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 813 aa  73.9  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  27.9 
 
 		 806 aa  71.6  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 827 aa  71.6  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  26.42 
 
 		 894 aa  69.7  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  28.46 
 
 		 805 aa  69.7  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  27.32 
 
 		 823 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 810 aa  69.3  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  24.89 
 
 		 815 aa  68.9  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  28.96 
 
 		 818 aa  67.8  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  27.95 
 
 		 816 aa  65.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 820 aa  64.7  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 812 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 817 aa  63.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 795 aa  61.6  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  25.09 
 
 		 814 aa  60.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 866 aa  59.3  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  28.11 
 
 		 897 aa  56.6  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  23.63 
 
 		 820 aa  56.2  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  32.05 
 
 		 1075 aa  55.1  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0796  hypothetical protein  28.94 
 
 		 772 aa  54.3  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 836 aa  53.9  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2221  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 		 1079 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  22.31 
 
 		 938 aa  53.9  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 883 aa  53.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 819 aa  52.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 771 aa  52.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4954  TonB-dependent receptor plug  34.19 
 
 		 1182 aa  52  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0461208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  26.09 
 
 		 931 aa  51.6  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 763 aa  50.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  28.03 
 
 		 808 aa  50.4  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 1050 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  34.65 
 
 		 767 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1574  TonB-dependent receptor plug  27.44 
 
 		 1155 aa  49.7  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923861  normal  0.0467053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  30.56 
 
 		 793 aa  49.3  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 924 aa  48.9  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 798 aa  48.5  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 791 aa  48.5  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 828 aa  47.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  29.88 
 
 		 831 aa  47.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  28.19 
 
 		 725 aa  47.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  27.37 
 
 		 1067 aa  47.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  28.3 
 
 		 1044 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  28.91 
 
 		 962 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0628  Outer membrane cobalamin receptor protein-like  25.93 
 
 		 638 aa  46.6  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000288278  normal  0.81106 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>