71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1397 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1397  hypothetical protein  100 
 
 		 995 aa  2020    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2796  hypothetical protein  64.39 
 
 		 936 aa  1210    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  28 
 
 		 961 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 998 aa  237  9e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  25.23 
 
 		 921 aa  213  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  29.76 
 
 		 872 aa  204  6e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  25.57 
 
 		 965 aa  203  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  26.1 
 
 		 946 aa  197  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  24.76 
 
 		 887 aa  192  2e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  25.11 
 
 		 847 aa  179  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  24.47 
 
 		 952 aa  176  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  26.9 
 
 		 930 aa  170  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  25.26 
 
 		 929 aa  140  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  24.87 
 
 		 904 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  23.16 
 
 		 929 aa  131  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2458  hypothetical protein  23.1 
 
 		 908 aa  112  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  34.33 
 
 		 920 aa  108  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  28.15 
 
 		 924 aa  100  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  25 
 
 		 944 aa  89.7  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  32.8 
 
 		 926 aa  89.7  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  25.88 
 
 		 895 aa  80.9  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  24.89 
 
 		 915 aa  80.1  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1654  hypothetical protein  28.46 
 
 		 879 aa  80.1  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 817 aa  73.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6640  hypothetical protein  25.2 
 
 		 946 aa  72  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 813 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 829 aa  70.1  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  24.71 
 
 		 804 aa  69.3  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_002950  PG0441  hypothetical protein  24.89 
 
 		 877 aa  67.8  0.0000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 827 aa  63.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  23.58 
 
 		 806 aa  63.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  26.11 
 
 		 891 aa  62.4  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 817 aa  60.1  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  22.3 
 
 		 818 aa  58.5  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  22.76 
 
 		 847 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  21.38 
 
 		 816 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 832 aa  57  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 813 aa  56.2  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 802 aa  56.2  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 869 aa  55.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 973 aa  55.8  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  26 
 
 		 823 aa  55.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  23.37 
 
 		 800 aa  55.1  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 805 aa  54.3  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 826 aa  54.3  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 		 866 aa  53.9  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  23.38 
 
 		 853 aa  52.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  23.28 
 
 		 894 aa  52.4  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 		 812 aa  52.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 794 aa  52  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  24.8 
 
 		 818 aa  52  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  25.13 
 
 		 814 aa  52  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  22.92 
 
 		 766 aa  51.6  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  21.93 
 
 		 808 aa  51.6  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 798 aa  51.6  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  26.2 
 
 		 1041 aa  51.2  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 883 aa  50.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  22.75 
 
 		 813 aa  50.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  22.55 
 
 		 830 aa  50.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  24.14 
 
 		 805 aa  50.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  25.29 
 
 		 807 aa  50.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 852 aa  50.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  28.19 
 
 		 725 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3796  hypothetical protein  30.08 
 
 		 409 aa  49.7  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 934 aa  49.7  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 803 aa  49.3  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 820 aa  48.9  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 836 aa  47.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  25.7 
 
 		 799 aa  46.2  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  23.25 
 
 		 788 aa  45.1  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 791 aa  44.7  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>