272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3278 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  53.02 
 
 		 852 aa  823    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  56.71 
 
 		 853 aa  920    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  53.12 
 
 		 934 aa  840    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  53.19 
 
 		 829 aa  804    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 973 aa  1968    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  53.74 
 
 		 869 aa  804    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  44.87 
 
 		 832 aa  635  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  36.16 
 
 		 802 aa  485  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  38.81 
 
 		 812 aa  469  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  36.69 
 
 		 813 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  34.05 
 
 		 817 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  33.9 
 
 		 812 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  31.57 
 
 		 822 aa  294  6e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 830 aa  293  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 810 aa  282  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  29.4 
 
 		 766 aa  280  7e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 821 aa  276  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 808 aa  253  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  29.1 
 
 		 815 aa  252  3e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 824 aa  246  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  26.95 
 
 		 894 aa  245  3e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 818 aa  245  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  27.48 
 
 		 810 aa  240  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 820 aa  238  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  29.16 
 
 		 791 aa  237  6e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 819 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 826 aa  235  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  27.9 
 
 		 805 aa  229  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  29.08 
 
 		 715 aa  228  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  29.14 
 
 		 804 aa  218  4e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  26.56 
 
 		 828 aa  210  9e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 866 aa  209  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 817 aa  204  8e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 827 aa  200  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 705 aa  194  7e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  25.28 
 
 		 805 aa  188  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  25.79 
 
 		 814 aa  185  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  26.29 
 
 		 816 aa  184  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 813 aa  181  5.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 813 aa  177  9e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 803 aa  173  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  24.91 
 
 		 818 aa  173  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 847 aa  173  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 793 aa  173  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  25.19 
 
 		 800 aa  172  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 795 aa  171  5e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  24.55 
 
 		 814 aa  167  5.9999999999999996e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  26.01 
 
 		 897 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  22.35 
 
 		 820 aa  154  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  24.82 
 
 		 799 aa  149  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 805 aa  144  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 794 aa  142  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  34.96 
 
 		 823 aa  131  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  23.77 
 
 		 806 aa  130  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  24.49 
 
 		 725 aa  128  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 883 aa  127  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  23.78 
 
 		 709 aa  117  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 748 aa  114  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 611 aa  111  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  28.69 
 
 		 946 aa  107  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  32.22 
 
 		 961 aa  106  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  30.7 
 
 		 998 aa  105  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  31.34 
 
 		 965 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0796  hypothetical protein  24.61 
 
 		 772 aa  95.1  6e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  28.21 
 
 		 904 aa  79  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  27.51 
 
 		 944 aa  73.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  24.9 
 
 		 926 aa  73.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  32.14 
 
 		 931 aa  73.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  28.14 
 
 		 924 aa  72  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 		 962 aa  71.2  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  25.93 
 
 		 887 aa  70.1  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4518  TonB-dependent receptor  22.7 
 
 		 705 aa  69.7  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  28.79 
 
 		 833 aa  67.4  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  26.63 
 
 		 920 aa  67.8  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  25.11 
 
 		 952 aa  66.2  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  30.27 
 
 		 929 aa  65.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  29.07 
 
 		 1014 aa  65.5  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  27.62 
 
 		 895 aa  65.1  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 946 aa  64.7  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4146  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 961 aa  64.3  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960595  normal  0.432652 
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  28.19 
 
 		 891 aa  63.2  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0089  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 957 aa  63.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  37.89 
 
 		 797 aa  62.4  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2796  hypothetical protein  25.76 
 
 		 936 aa  62  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  26.12 
 
 		 753 aa  62  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  26.61 
 
 		 872 aa  61.6  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  26.4 
 
 		 848 aa  61.6  0.00000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  20.87 
 
 		 635 aa  61.2  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  25.65 
 
 		 760 aa  60.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  27.27 
 
 		 915 aa  59.7  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  34.29 
 
 		 847 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  21.17 
 
 		 653 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  23.41 
 
 		 929 aa  57.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  24.83 
 
 		 902 aa  57.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 962 aa  57.4  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 1004 aa  57  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  29.08 
 
 		 1137 aa  57  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  25.89 
 
 		 706 aa  57  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  28.08 
 
 		 932 aa  56.6  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  30.83 
 
 		 921 aa  56.2  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>