103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1267 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 805 aa  1655    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 820 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 827 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 		 816 aa  356  8.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 847 aa  349  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  31.87 
 
 		 725 aa  339  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 817 aa  329  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  28.1 
 
 		 805 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  26.5 
 
 		 814 aa  288  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 813 aa  281  3e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  27.11 
 
 		 818 aa  281  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 813 aa  274  6e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  27.35 
 
 		 709 aa  268  4e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  27.91 
 
 		 820 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 795 aa  248  4e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 611 aa  242  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  25.62 
 
 		 806 aa  239  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 		 897 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 794 aa  237  6e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 883 aa  229  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 793 aa  225  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 799 aa  222  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 705 aa  214  3.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 830 aa  201  6e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 818 aa  198  4.0000000000000005e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 821 aa  196  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  24.32 
 
 		 805 aa  195  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 802 aa  194  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 813 aa  191  7e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 808 aa  185  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 		 824 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 748 aa  180  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 810 aa  178  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  24.42 
 
 		 800 aa  177  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  23.97 
 
 		 810 aa  164  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 791 aa  161  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 822 aa  160  8e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  25.21 
 
 		 766 aa  159  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 826 aa  157  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 819 aa  154  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 803 aa  154  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  26.96 
 
 		 812 aa  152  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 866 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 934 aa  147  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 973 aa  145  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  25.75 
 
 		 804 aa  145  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  23.21 
 
 		 828 aa  145  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  25.17 
 
 		 853 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 829 aa  142  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 852 aa  141  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  20.72 
 
 		 815 aa  140  7.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  24.9 
 
 		 715 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 832 aa  136  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 		 869 aa  133  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4518  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 705 aa  129  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  22.59 
 
 		 823 aa  114  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  21.56 
 
 		 894 aa  105  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 817 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0796  hypothetical protein  24.25 
 
 		 772 aa  95.1  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  31.55 
 
 		 812 aa  94.7  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  22.93 
 
 		 814 aa  94.4  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  20.94 
 
 		 782 aa  85.9  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  27.27 
 
 		 961 aa  82  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  24.88 
 
 		 930 aa  65.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  28.33 
 
 		 952 aa  65.1  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 998 aa  64.7  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  21.88 
 
 		 887 aa  63.5  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  24.39 
 
 		 920 aa  63.9  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  23.72 
 
 		 921 aa  62.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 757 aa  62  0.00000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  26.85 
 
 		 915 aa  60.8  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  32.54 
 
 		 838 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  21.22 
 
 		 929 aa  59.3  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  24.54 
 
 		 946 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 		 836 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1397  hypothetical protein  28.22 
 
 		 995 aa  56.2  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243953 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 946 aa  52.8  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  23.28 
 
 		 965 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 1089 aa  52.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 842 aa  52.8  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  25.55 
 
 		 972 aa  52.4  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  23.03 
 
 		 926 aa  52  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2796  hypothetical protein  27.18 
 
 		 936 aa  51.6  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  21.97 
 
 		 924 aa  51.6  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03327  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 862 aa  51.2  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  25.55 
 
 		 988 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  24.9 
 
 		 833 aa  49.3  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 833 aa  49.3  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  27.19 
 
 		 747 aa  49.3  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  24.04 
 
 		 907 aa  48.5  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4146  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 961 aa  48.1  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960595  normal  0.432652 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  31.71 
 
 		 938 aa  48.1  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 798 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  26.44 
 
 		 1094 aa  47.8  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  28.44 
 
 		 767 aa  47  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  24.19 
 
 		 904 aa  46.2  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  25.68 
 
 		 872 aa  45.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1394  TonB-dependent receptor, plug  30.07 
 
 		 713 aa  44.7  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0833322 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  26.8 
 
 		 614 aa  44.7  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  25.68 
 
 		 932 aa  44.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>