277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6739 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  50.68 
 
 		 869 aa  775    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  44.87 
 
 		 973 aa  641    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  50.93 
 
 		 829 aa  797    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  48.41 
 
 		 852 aa  728    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  45.15 
 
 		 934 aa  645    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  45.99 
 
 		 853 aa  645    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 832 aa  1676    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  32.79 
 
 		 802 aa  396  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  33.21 
 
 		 813 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 817 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  34.12 
 
 		 812 aa  369  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  32.4 
 
 		 812 aa  351  3e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 830 aa  292  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  29.21 
 
 		 766 aa  282  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 810 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 818 aa  274  6e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 821 aa  261  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 826 aa  261  5.0000000000000005e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 822 aa  246  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 808 aa  242  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  29.45 
 
 		 810 aa  235  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 824 aa  232  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  28.88 
 
 		 815 aa  229  1e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 791 aa  228  4e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 820 aa  224  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  26.97 
 
 		 828 aa  221  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  27.15 
 
 		 894 aa  220  8.999999999999998e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 819 aa  212  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  27.56 
 
 		 715 aa  209  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 827 aa  207  6e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 847 aa  207  8e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 814 aa  206  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 705 aa  205  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 817 aa  198  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  24.91 
 
 		 805 aa  196  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 804 aa  190  9e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 795 aa  188  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  23.81 
 
 		 818 aa  185  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  27.44 
 
 		 820 aa  183  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 803 aa  181  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 813 aa  181  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 866 aa  177  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  26.33 
 
 		 805 aa  175  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  27.11 
 
 		 816 aa  172  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  26.82 
 
 		 897 aa  164  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 793 aa  160  7e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  26.1 
 
 		 725 aa  160  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  23.67 
 
 		 800 aa  157  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  24.72 
 
 		 806 aa  155  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 883 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 813 aa  147  7.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 794 aa  145  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  24.33 
 
 		 799 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 805 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  36.04 
 
 		 823 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  29.79 
 
 		 814 aa  132  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 611 aa  126  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 998 aa  115  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 748 aa  113  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  27.61 
 
 		 709 aa  112  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  30.12 
 
 		 961 aa  97.8  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  28.51 
 
 		 946 aa  93.2  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  27.36 
 
 		 926 aa  89.7  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  29.41 
 
 		 965 aa  86.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  29.25 
 
 		 904 aa  84.7  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  26.42 
 
 		 930 aa  82.4  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  28.24 
 
 		 952 aa  80.9  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  25.24 
 
 		 887 aa  77.8  0.0000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  27.56 
 
 		 944 aa  77.8  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  25.55 
 
 		 924 aa  77.8  0.0000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4518  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 705 aa  75.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  27.42 
 
 		 895 aa  69.3  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  25.46 
 
 		 921 aa  68.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0796  hypothetical protein  22.24 
 
 		 772 aa  66.6  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0089  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 957 aa  65.1  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  25.65 
 
 		 891 aa  64.3  0.000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  28.5 
 
 		 847 aa  64.3  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 		 791 aa  64.3  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2796  hypothetical protein  23.95 
 
 		 936 aa  63.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  29.19 
 
 		 817 aa  62.4  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  22.32 
 
 		 782 aa  62.8  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  25 
 
 		 915 aa  62.8  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2458  hypothetical protein  25.75 
 
 		 908 aa  61.6  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 753 aa  61.6  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 710 aa  61.6  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 946 aa  61.6  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  30.37 
 
 		 924 aa  61.6  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  26.27 
 
 		 929 aa  61.2  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  29.89 
 
 		 929 aa  60.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 1014 aa  60.1  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  24.21 
 
 		 920 aa  60.1  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  30.57 
 
 		 783 aa  60.1  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4146  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 961 aa  59.3  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960595  normal  0.432652 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 1089 aa  58.5  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  27.46 
 
 		 706 aa  58.5  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 972 aa  58.2  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  33.64 
 
 		 753 aa  58.2  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  37.19 
 
 		 635 aa  57.8  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1397  hypothetical protein  24.42 
 
 		 995 aa  57.4  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243953 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 897 aa  56.2  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>