173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2740 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 725 aa  1486    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  32.63 
 
 		 847 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  31.87 
 
 		 805 aa  340  8e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 827 aa  323  6e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  32.68 
 
 		 817 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 820 aa  313  4.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  31.62 
 
 		 816 aa  302  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 806 aa  300  6e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  28.89 
 
 		 709 aa  290  7e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 813 aa  288  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 794 aa  286  1.0000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  30.13 
 
 		 805 aa  284  4.0000000000000003e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 		 818 aa  278  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  32.63 
 
 		 611 aa  278  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 793 aa  273  6e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 883 aa  261  3e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 795 aa  259  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  28.65 
 
 		 799 aa  254  4.0000000000000004e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  28.69 
 
 		 814 aa  246  9e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 705 aa  246  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 813 aa  245  3e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  29.99 
 
 		 897 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  27.22 
 
 		 820 aa  213  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 826 aa  184  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 748 aa  183  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 830 aa  180  8e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 821 aa  178  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  26.3 
 
 		 766 aa  178  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 810 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 808 aa  173  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  25.71 
 
 		 815 aa  172  3e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 818 aa  170  7e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 822 aa  169  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 824 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  26.47 
 
 		 715 aa  167  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  25.03 
 
 		 812 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 866 aa  165  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  23.07 
 
 		 805 aa  162  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 813 aa  157  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 832 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 802 aa  155  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 803 aa  147  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 817 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  25.91 
 
 		 810 aa  142  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 869 aa  141  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 829 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  24.27 
 
 		 804 aa  135  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 819 aa  134  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 791 aa  130  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 973 aa  130  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 812 aa  127  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  22.97 
 
 		 894 aa  123  9e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4518  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 705 aa  123  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 852 aa  121  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 934 aa  115  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  24.8 
 
 		 853 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  23.86 
 
 		 782 aa  110  7.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  23.38 
 
 		 828 aa  97.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0796  hypothetical protein  24.4 
 
 		 772 aa  93.2  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  35.53 
 
 		 800 aa  92  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  23.75 
 
 		 814 aa  90.5  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  26.52 
 
 		 926 aa  75.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  30.91 
 
 		 847 aa  73.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  25.83 
 
 		 887 aa  60.5  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  27.49 
 
 		 929 aa  60.1  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  27.11 
 
 		 930 aa  60.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  28.31 
 
 		 961 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  26.39 
 
 		 952 aa  58.9  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.33 
 
 		 614 aa  58.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  28.4 
 
 		 921 aa  57.4  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  30.32 
 
 		 634 aa  57  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  34.39 
 
 		 637 aa  56.6  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.33 
 
 		 614 aa  56.6  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.33 
 
 		 614 aa  56.6  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.33 
 
 		 614 aa  56.6  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.33 
 
 		 614 aa  56.6  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  28.12 
 
 		 617 aa  55.1  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 688 aa  54.3  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  30.3 
 
 		 613 aa  54.3  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 920 aa  54.3  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  30.99 
 
 		 965 aa  54.3  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  36 
 
 		 615 aa  53.9  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2796  hypothetical protein  28 
 
 		 936 aa  53.5  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  31.29 
 
 		 614 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.29 
 
 		 614 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.29 
 
 		 614 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.97 
 
 		 614 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.29 
 
 		 614 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  24.2 
 
 		 915 aa  52.4  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  25.74 
 
 		 891 aa  52.4  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 998 aa  52.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.29 
 
 		 614 aa  52.8  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.56 
 
 		 631 aa  52  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  27.96 
 
 		 872 aa  51.2  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1397  hypothetical protein  28.19 
 
 		 995 aa  51.2  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243953 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0621  TonB-dependent receptor plug  26.54 
 
 		 713 aa  51.2  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  30.86 
 
 		 646 aa  50.8  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0603  outer membrane receptor FepA  26.44 
 
 		 746 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0667  outer membrane receptor FepA  26.44 
 
 		 746 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00539  hypothetical protein  26.44 
 
 		 746 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000136629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>