More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0252 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 805 aa  1632    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  31.9 
 
 		 822 aa  325  2e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 820 aa  310  5e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 821 aa  310  8e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 808 aa  308  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  30.06 
 
 		 815 aa  308  3e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 830 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 810 aa  295  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 824 aa  287  5.999999999999999e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 818 aa  284  6.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 829 aa  277  5e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 866 aa  277  6e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 826 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 817 aa  272  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 802 aa  272  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  29.49 
 
 		 805 aa  271  4e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 827 aa  269  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 847 aa  263  6.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 791 aa  261  5.0000000000000005e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 813 aa  246  9e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  27.45 
 
 		 766 aa  246  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 869 aa  243  7e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 813 aa  242  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  26.37 
 
 		 828 aa  239  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 934 aa  232  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  29.46 
 
 		 812 aa  231  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 973 aa  229  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  26.59 
 
 		 800 aa  227  9e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 883 aa  219  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 817 aa  218  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  27.63 
 
 		 816 aa  214  7e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 852 aa  213  7.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  24.77 
 
 		 818 aa  213  9e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 813 aa  210  7e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  26.3 
 
 		 853 aa  209  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  25.74 
 
 		 814 aa  207  5e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 705 aa  205  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 803 aa  205  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  26.91 
 
 		 804 aa  196  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 814 aa  194  7e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 832 aa  193  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 812 aa  193  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  25.26 
 
 		 894 aa  192  2e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 805 aa  192  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  25.5 
 
 		 810 aa  182  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 819 aa  181  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 795 aa  181  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  25.18 
 
 		 799 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  23.26 
 
 		 897 aa  178  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  24.27 
 
 		 823 aa  172  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  24.19 
 
 		 806 aa  167  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  23.07 
 
 		 725 aa  162  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25.17 
 
 		 715 aa  159  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 611 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  25.29 
 
 		 820 aa  153  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 794 aa  148  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  21.74 
 
 		 709 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  23.1 
 
 		 748 aa  114  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  30.48 
 
 		 961 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 998 aa  95.5  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  28.78 
 
 		 965 aa  87.8  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  24.7 
 
 		 782 aa  87  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  24.29 
 
 		 946 aa  82.4  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  26.53 
 
 		 924 aa  77.8  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4518  TonB-dependent receptor  22.44 
 
 		 705 aa  75.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 793 aa  75.5  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  21.07 
 
 		 930 aa  73.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  35.34 
 
 		 779 aa  73.2  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  26.3 
 
 		 748 aa  72.8  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  26.26 
 
 		 833 aa  72  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  21.53 
 
 		 887 aa  70.9  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2796  hypothetical protein  22.21 
 
 		 936 aa  70.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  25.66 
 
 		 944 aa  70.1  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  26.59 
 
 		 920 aa  69.7  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  25.27 
 
 		 952 aa  68.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  24.37 
 
 		 926 aa  67.8  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  22.39 
 
 		 663 aa  68.2  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  26.5 
 
 		 760 aa  67.4  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4269  TonB-dependent receptor, plug  26.18 
 
 		 797 aa  66.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  23.9 
 
 		 921 aa  65.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  30.54 
 
 		 904 aa  65.5  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 952 aa  65.1  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 763 aa  64.3  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  23.6 
 
 		 848 aa  64.3  0.000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  25.64 
 
 		 666 aa  63.5  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 987 aa  63.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 866 aa  63.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4071  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 792 aa  63.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 833 aa  62.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 897 aa  62.4  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  26.67 
 
 		 847 aa  62  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 798 aa  62  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 947 aa  62  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 874 aa  61.6  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  23.11 
 
 		 1089 aa  61.6  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  25.68 
 
 		 663 aa  60.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  24.75 
 
 		 915 aa  60.8  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  28.35 
 
 		 814 aa  60.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  27.6 
 
 		 783 aa  60.1  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 661 aa  59.7  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>