More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1758 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1089 aa  2236    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  51.58 
 
 		 1087 aa  1042    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  30.35 
 
 		 966 aa  290  8e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 935 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  50.99 
 
 		 888 aa  188  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  49.33 
 
 		 952 aa  174  6.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  44.08 
 
 		 897 aa  169  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  38.25 
 
 		 1066 aa  140  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  42.2 
 
 		 1147 aa  117  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  54.87 
 
 		 957 aa  112  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  32.61 
 
 		 753 aa  107  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  32.64 
 
 		 848 aa  105  6e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  47.1 
 
 		 1075 aa  103  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  29.76 
 
 		 972 aa  97.8  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  35.47 
 
 		 747 aa  96.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  31.9 
 
 		 1109 aa  96.3  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  28.09 
 
 		 1070 aa  93.6  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  31.97 
 
 		 933 aa  90.1  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  30 
 
 		 1126 aa  89.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  31.36 
 
 		 757 aa  89  4e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  34.78 
 
 		 1082 aa  89  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  29.04 
 
 		 1120 aa  89.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  29.04 
 
 		 1122 aa  89  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  27.82 
 
 		 1114 aa  89  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  32.35 
 
 		 1004 aa  88.2  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 789 aa  87.8  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  32.38 
 
 		 1060 aa  87  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  31.93 
 
 		 791 aa  85.9  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  30.64 
 
 		 777 aa  84.7  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  33.79 
 
 		 806 aa  84  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  33.64 
 
 		 803 aa  84  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  32.78 
 
 		 1181 aa  84.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 790 aa  83.2  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 1038 aa  83.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1574  TonB-dependent receptor plug  26.71 
 
 		 1155 aa  83.2  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923861  normal  0.0467053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  30.33 
 
 		 1062 aa  83.2  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  26.49 
 
 		 1079 aa  82.8  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1769  TonB-dependent receptor plug  29.76 
 
 		 1085 aa  82.4  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  40.54 
 
 		 924 aa  82.4  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  28.7 
 
 		 833 aa  82  0.00000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  31.84 
 
 		 1036 aa  81.6  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  40.2 
 
 		 962 aa  81.6  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  28.86 
 
 		 812 aa  81.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  32.11 
 
 		 991 aa  80.1  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1482  TonB-dependent receptor plug  33.52 
 
 		 1051 aa  80.1  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0024542  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1163 aa  80.5  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  34.17 
 
 		 933 aa  80.5  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  29.07 
 
 		 1007 aa  80.1  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  29.02 
 
 		 831 aa  80.5  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01815  TonB-dependent receptor  39.45 
 
 		 927 aa  80.1  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  28.69 
 
 		 767 aa  80.1  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 893 aa  79.7  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 1188 aa  79.3  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 1000 aa  79  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0021  TonB-dependent receptor  30.21 
 
 		 976 aa  79  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  31.88 
 
 		 760 aa  79  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  30.98 
 
 		 1062 aa  79  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 818 aa  78.6  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 828 aa  78.6  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  27.78 
 
 		 775 aa  78.6  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  29.2 
 
 		 1051 aa  78.2  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  32.93 
 
 		 1173 aa  78.2  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  26.78 
 
 		 771 aa  77.4  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 		 1027 aa  77.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  30.38 
 
 		 1117 aa  77.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  28.94 
 
 		 788 aa  77  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 830 aa  77  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  29.61 
 
 		 1047 aa  77  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  28.47 
 
 		 1050 aa  76.6  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 845 aa  77  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  33.97 
 
 		 1001 aa  76.6  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 836 aa  77  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  37.64 
 
 		 1068 aa  76.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  26.84 
 
 		 760 aa  77  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  28.89 
 
 		 1106 aa  77  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 988 aa  77.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3310  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 		 971 aa  76.3  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.183606 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  29.39 
 
 		 791 aa  76.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  32.54 
 
 		 1076 aa  76.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  35.15 
 
 		 1175 aa  75.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 814 aa  75.9  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  30.47 
 
 		 1014 aa  75.5  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 1050 aa  75.5  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 1046 aa  75.5  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 798 aa  75.1  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 797 aa  75.1  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1028 aa  75.1  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  31.28 
 
 		 1041 aa  75.1  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  32.57 
 
 		 1064 aa  75.1  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 993 aa  74.7  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 793 aa  74.7  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  33.16 
 
 		 1006 aa  74.7  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  27.2 
 
 		 1067 aa  74.3  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  31.95 
 
 		 1076 aa  74.3  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  28.14 
 
 		 888 aa  73.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  33.85 
 
 		 1034 aa  73.9  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  34.78 
 
 		 1020 aa  73.9  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  36.98 
 
 		 1023 aa  74.3  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  30.43 
 
 		 795 aa  74.3  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 924 aa  73.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>