124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5762 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  44.21 
 
 		 929 aa  754    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  100 
 
 		 965 aa  1937    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  34.35 
 
 		 998 aa  511  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  34.05 
 
 		 961 aa  481  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  34.02 
 
 		 946 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  29.41 
 
 		 921 aa  322  3e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  30.37 
 
 		 847 aa  316  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  27.8 
 
 		 887 aa  303  9e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  29.44 
 
 		 930 aa  302  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  27.91 
 
 		 952 aa  296  9e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  29.01 
 
 		 920 aa  296  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  27.26 
 
 		 924 aa  265  4e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  27.14 
 
 		 904 aa  244  7e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  26.62 
 
 		 929 aa  242  2.9999999999999997e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2458  hypothetical protein  25.82 
 
 		 908 aa  229  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  27.43 
 
 		 926 aa  229  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2796  hypothetical protein  26.82 
 
 		 936 aa  214  9e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1397  hypothetical protein  25.35 
 
 		 995 aa  197  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  25.41 
 
 		 944 aa  190  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  25.32 
 
 		 872 aa  189  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  31.92 
 
 		 895 aa  139  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6640  hypothetical protein  23.2 
 
 		 946 aa  124  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  22.27 
 
 		 915 aa  124  9e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 		 830 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 817 aa  112  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  22.25 
 
 		 805 aa  111  8.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 829 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 		 973 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 822 aa  98.6  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 		 869 aa  92.8  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  29.39 
 
 		 812 aa  92  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  26.39 
 
 		 891 aa  90.5  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_002950  PG0441  hypothetical protein  28.85 
 
 		 877 aa  90.1  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  20.36 
 
 		 820 aa  89.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 802 aa  89  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 808 aa  87.4  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  31.94 
 
 		 853 aa  87.4  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  27.44 
 
 		 804 aa  86.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 832 aa  85.1  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  28.31 
 
 		 805 aa  85.1  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  25.28 
 
 		 828 aa  84.3  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  31.2 
 
 		 813 aa  82.8  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  31.52 
 
 		 818 aa  82.8  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  21.82 
 
 		 847 aa  82.4  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  23.19 
 
 		 766 aa  81.3  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 813 aa  80.9  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 818 aa  79  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 		 814 aa  78.2  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 826 aa  78.6  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 824 aa  75.5  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  29.54 
 
 		 814 aa  75.5  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 810 aa  74.3  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 962 aa  69.7  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  32.67 
 
 		 795 aa  68.9  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 821 aa  68.9  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  27.19 
 
 		 806 aa  68.2  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  25.9 
 
 		 800 aa  68.2  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0089  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 957 aa  67.4  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 866 aa  67  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  24.66 
 
 		 815 aa  65.9  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 938 aa  65.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  26.52 
 
 		 823 aa  65.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 812 aa  64.3  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  26.72 
 
 		 810 aa  64.3  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 791 aa  62  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  21.01 
 
 		 803 aa  61.6  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 819 aa  61.2  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 813 aa  61.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 794 aa  60.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  30.41 
 
 		 1058 aa  60.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 972 aa  60.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1654  hypothetical protein  26.98 
 
 		 879 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 817 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  24.69 
 
 		 894 aa  59.3  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  28.31 
 
 		 715 aa  57.8  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 798 aa  57  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 1004 aa  56.6  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  26.38 
 
 		 932 aa  55.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  26.1 
 
 		 988 aa  55.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  26.96 
 
 		 782 aa  55.8  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 1066 aa  55.5  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1015  tonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 750 aa  55.1  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 931 aa  54.7  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04680  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 757 aa  53.5  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.868178  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  30.99 
 
 		 725 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  30.64 
 
 		 1039 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4146  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 961 aa  52.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960595  normal  0.432652 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  25.82 
 
 		 799 aa  51.2  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  18.77 
 
 		 827 aa  50.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 1140 aa  50.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1572  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 780 aa  50.8  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0693034  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  22.57 
 
 		 917 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0185  ragA protein  27.67 
 
 		 1017 aa  49.7  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.458513 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 1080 aa  48.9  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  25.62 
 
 		 872 aa  48.5  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 831 aa  48.5  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 883 aa  48.5  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 805 aa  48.5  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 866 aa  48.5  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  22.71 
 
 		 763 aa  47.8  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>