More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3236 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 808 aa  1671    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  45.94 
 
 		 810 aa  697    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  65.39 
 
 		 821 aa  1088    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  35.49 
 
 		 822 aa  479  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  36.69 
 
 		 815 aa  476  1e-133  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 		 824 aa  360  6e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 830 aa  359  9.999999999999999e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  31.66 
 
 		 820 aa  347  5e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  30.02 
 
 		 791 aa  344  4e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  30.33 
 
 		 818 aa  332  3e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  31.69 
 
 		 826 aa  331  3e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  29.25 
 
 		 766 aa  312  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 829 aa  310  5e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  29.91 
 
 		 805 aa  308  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 817 aa  290  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 802 aa  286  7e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 866 aa  287  7e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 817 aa  286  9e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 813 aa  285  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 827 aa  281  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  29.9 
 
 		 805 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  27.91 
 
 		 800 aa  270  5.9999999999999995e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 847 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  28.55 
 
 		 812 aa  265  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 804 aa  263  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  28.34 
 
 		 814 aa  261  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 813 aa  258  3e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 869 aa  255  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 973 aa  254  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  28.16 
 
 		 828 aa  255  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 813 aa  252  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  26.57 
 
 		 818 aa  250  7e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 852 aa  250  9e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 		 853 aa  246  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 803 aa  245  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 812 aa  243  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 832 aa  242  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  25.66 
 
 		 814 aa  232  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  27.95 
 
 		 823 aa  230  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 705 aa  229  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 934 aa  228  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  28.53 
 
 		 816 aa  223  9e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  27.02 
 
 		 820 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 806 aa  215  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 883 aa  200  7e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  26.1 
 
 		 799 aa  196  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 794 aa  186  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 819 aa  185  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 805 aa  182  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 611 aa  181  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 795 aa  181  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  25.34 
 
 		 725 aa  173  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  25.75 
 
 		 709 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 793 aa  165  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  25.03 
 
 		 894 aa  162  3e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  23.56 
 
 		 715 aa  156  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 748 aa  127  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  30.74 
 
 		 897 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 810 aa  112  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  29.03 
 
 		 961 aa  98.2  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  28.03 
 
 		 924 aa  96.7  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0796  hypothetical protein  21.04 
 
 		 772 aa  95.5  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  26.91 
 
 		 965 aa  88.6  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  29.06 
 
 		 952 aa  87.8  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  26.89 
 
 		 929 aa  82.8  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  23.93 
 
 		 930 aa  81.6  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 998 aa  80.9  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  25 
 
 		 946 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  25.69 
 
 		 887 aa  75.9  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  25.91 
 
 		 904 aa  73.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  21.29 
 
 		 782 aa  73.6  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  23.4 
 
 		 921 aa  73.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  23.05 
 
 		 920 aa  72.4  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2445  TonB-dependent receptor plug  26.72 
 
 		 1094 aa  71.6  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  25 
 
 		 926 aa  70.5  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  29.1 
 
 		 783 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  25.65 
 
 		 891 aa  68.6  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  29.28 
 
 		 1103 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 853 aa  65.5  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 946 aa  63.5  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 		 1038 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00302  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 746 aa  62.4  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0777336  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 924 aa  62.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 		 769 aa  60.1  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  27.52 
 
 		 838 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2646  TonB-dependent receptor plug  27.65 
 
 		 790 aa  59.7  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  24.43 
 
 		 929 aa  60.1  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4518  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 705 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  30.92 
 
 		 681 aa  60.1  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  30.92 
 
 		 614 aa  59.3  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  27.93 
 
 		 847 aa  59.3  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4269  TonB-dependent receptor, plug  24.71 
 
 		 797 aa  59.3  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  26.07 
 
 		 760 aa  58.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11443  ferrichrome-iron receptor  28.39 
 
 		 792 aa  58.2  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.601841  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 678 aa  57.8  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  30.95 
 
 		 753 aa  57.8  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  23.44 
 
 		 919 aa  57.8  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  24.68 
 
 		 915 aa  57.8  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 1086 aa  57.8  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  25.38 
 
 		 872 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>