192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6378 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 828 aa  1691    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  32.31 
 
 		 866 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  31.49 
 
 		 824 aa  348  3e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 826 aa  314  4.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 810 aa  288  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 818 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 821 aa  267  5.999999999999999e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 830 aa  265  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  30.64 
 
 		 817 aa  258  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 822 aa  256  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 808 aa  255  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 791 aa  253  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 820 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 813 aa  240  5.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  26.37 
 
 		 805 aa  239  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 852 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 832 aa  221  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  25.46 
 
 		 766 aa  221  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 829 aa  219  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  26.59 
 
 		 815 aa  215  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  25.76 
 
 		 800 aa  213  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 973 aa  211  5e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 812 aa  211  5e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 847 aa  211  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  25.66 
 
 		 812 aa  210  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 869 aa  206  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 803 aa  204  8e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 827 aa  199  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 802 aa  196  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  27.97 
 
 		 853 aa  194  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 934 aa  186  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 817 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  27.31 
 
 		 816 aa  178  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  25.65 
 
 		 805 aa  178  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  24.69 
 
 		 818 aa  174  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  25.29 
 
 		 804 aa  168  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 799 aa  161  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  24.97 
 
 		 814 aa  160  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  25.88 
 
 		 823 aa  157  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  24.78 
 
 		 897 aa  148  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 813 aa  147  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 805 aa  145  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 813 aa  145  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 819 aa  144  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  27.11 
 
 		 814 aa  144  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 795 aa  139  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  24.82 
 
 		 894 aa  137  6.0000000000000005e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 611 aa  137  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  24.88 
 
 		 820 aa  136  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  23.06 
 
 		 810 aa  135  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 705 aa  124  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  24.21 
 
 		 709 aa  122  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 883 aa  118  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 806 aa  115  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  27.74 
 
 		 961 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  22.68 
 
 		 794 aa  99.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  23.38 
 
 		 725 aa  97.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  27.31 
 
 		 924 aa  94.4  7e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  21.24 
 
 		 793 aa  92.4  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 748 aa  91.3  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 998 aa  87  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  25.28 
 
 		 965 aa  85.5  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  24.91 
 
 		 944 aa  82  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  25.79 
 
 		 946 aa  81.6  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  31.12 
 
 		 952 aa  80.5  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  23.16 
 
 		 872 aa  74.7  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  30.71 
 
 		 715 aa  71.2  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  23.83 
 
 		 887 aa  69.3  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 962 aa  69.3  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  21.8 
 
 		 929 aa  68.6  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  25.1 
 
 		 921 aa  68.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  23.33 
 
 		 930 aa  68.9  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  21.43 
 
 		 920 aa  68.2  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  26.72 
 
 		 904 aa  67.8  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  25.1 
 
 		 833 aa  67.4  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 757 aa  66.6  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 991 aa  64.7  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 919 aa  64.3  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 1004 aa  63.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  28.99 
 
 		 809 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  24.75 
 
 		 782 aa  62.8  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1066 aa  62  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 938 aa  61.2  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  25.07 
 
 		 848 aa  59.3  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  30.74 
 
 		 808 aa  58.9  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4954  TonB-dependent receptor plug  37.11 
 
 		 1182 aa  58.9  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0461208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  31.82 
 
 		 907 aa  58.9  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  25.31 
 
 		 847 aa  58.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  27.61 
 
 		 809 aa  58.5  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  24.63 
 
 		 783 aa  58.2  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0796  hypothetical protein  23.62 
 
 		 772 aa  58.2  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 760 aa  57.8  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  27.65 
 
 		 1148 aa  57.8  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 920 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  26.12 
 
 		 931 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  29.93 
 
 		 1075 aa  56.2  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 893 aa  56.2  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  25.69 
 
 		 747 aa  56.2  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  30.97 
 
 		 779 aa  55.8  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 972 aa  55.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>