More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1121 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  42.25 
 
 		 938 aa  697    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 919 aa  1876    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  62.31 
 
 		 972 aa  1165    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  62.38 
 
 		 946 aa  1228    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  41.52 
 
 		 962 aa  622  1e-176  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 		 917 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 944 aa  397  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4146  TonB-dependent receptor  31.99 
 
 		 961 aa  399  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960595  normal  0.432652 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 942 aa  392  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 		 941 aa  392  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  31.32 
 
 		 943 aa  380  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  31.02 
 
 		 936 aa  365  3e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 901 aa  352  1e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 943 aa  345  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  33.29 
 
 		 836 aa  341  4e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 945 aa  332  2e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  30.98 
 
 		 838 aa  331  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  30.38 
 
 		 853 aa  319  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  28.41 
 
 		 972 aa  315  2.9999999999999996e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 842 aa  313  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2369  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 935 aa  303  1e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 1004 aa  258  5e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 1001 aa  245  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 917 aa  240  6.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 920 aa  238  5.0000000000000005e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  23.54 
 
 		 932 aa  213  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00302  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 746 aa  206  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0777336  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 859 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 904 aa  190  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03327  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 862 aa  172  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 957 aa  171  8e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 948 aa  169  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 892 aa  167  9e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  31.71 
 
 		 991 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 914 aa  166  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02336  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 		 889 aa  163  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0825116  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 924 aa  161  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0889  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  21.9 
 
 		 992 aa  159  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000114339  unclonable  0.0000000138215 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 934 aa  157  8e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 880 aa  157  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 951 aa  157  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 951 aa  156  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 951 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 922 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 994 aa  149  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  25.14 
 
 		 908 aa  146  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1716  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 		 1051 aa  147  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.854404  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01815  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 927 aa  143  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  22.79 
 
 		 943 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  34.1 
 
 		 915 aa  142  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 		 931 aa  138  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  21.81 
 
 		 933 aa  137  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 918 aa  137  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  22.93 
 
 		 940 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  23.41 
 
 		 1035 aa  135  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04688  TonB-dependent receptor  23.29 
 
 		 918 aa  135  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 957 aa  128  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 921 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 912 aa  122  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2575  TonB-dependent receptor  22.82 
 
 		 897 aa  120  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.118608 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3993  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 		 897 aa  119  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.494791  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  31.2 
 
 		 933 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3125  TonB-dependent receptor  22.72 
 
 		 785 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 875 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  27.42 
 
 		 878 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  27.42 
 
 		 878 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  27.42 
 
 		 878 aa  112  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 906 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  27.42 
 
 		 878 aa  111  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 926 aa  110  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 908 aa  109  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  25.92 
 
 		 919 aa  108  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 894 aa  107  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 868 aa  106  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 868 aa  106  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  25.92 
 
 		 908 aa  105  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  33.04 
 
 		 962 aa  105  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  22.98 
 
 		 838 aa  105  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0379  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 		 888 aa  105  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0418446  normal  0.660962 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1075  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 601 aa  104  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 892 aa  104  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 875 aa  104  8e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3601  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 1090 aa  104  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000169408  hitchhiker  0.00028286 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  24.53 
 
 		 918 aa  104  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  28.88 
 
 		 931 aa  104  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 880 aa  104  9e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  25.92 
 
 		 908 aa  103  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 885 aa  103  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 908 aa  103  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 936 aa  102  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 936 aa  102  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 927 aa  101  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1988  TonB-dependent receptor plug  22.34 
 
 		 1003 aa  100  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.485528  normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 978 aa  100  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 976 aa  100  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 1036 aa  100  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 925 aa  99.4  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3857  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 1077 aa  98.2  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  26.91 
 
 		 970 aa  98.2  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 888 aa  98.6  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>