126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3170 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 827 aa  1694    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  52.68 
 
 		 817 aa  824    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  43.23 
 
 		 820 aa  671    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  42.06 
 
 		 816 aa  583  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  38.71 
 
 		 847 aa  562  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  38.25 
 
 		 814 aa  543  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  36.36 
 
 		 813 aa  478  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  37.47 
 
 		 805 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  32.78 
 
 		 818 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  33.46 
 
 		 813 aa  391  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  30.37 
 
 		 805 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  37.3 
 
 		 611 aa  355  1e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  33.96 
 
 		 705 aa  353  5.9999999999999994e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  33.53 
 
 		 897 aa  349  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  30.14 
 
 		 806 aa  348  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  29 
 
 		 820 aa  332  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  30.82 
 
 		 725 aa  323  7e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 821 aa  315  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 810 aa  313  5.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  31.13 
 
 		 709 aa  311  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 795 aa  284  5.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 808 aa  281  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  27.35 
 
 		 799 aa  273  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 883 aa  270  7e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  28.74 
 
 		 805 aa  269  1e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 830 aa  269  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 826 aa  266  8.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 793 aa  261  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 824 aa  257  6e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 818 aa  257  8e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  27.84 
 
 		 800 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 791 aa  252  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 794 aa  250  7e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 813 aa  247  8e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 822 aa  244  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  26.61 
 
 		 815 aa  239  1e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 869 aa  238  4e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 866 aa  236  9e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  28.5 
 
 		 812 aa  232  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 802 aa  231  6e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 829 aa  228  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  24.55 
 
 		 766 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 934 aa  211  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 817 aa  210  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 832 aa  203  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 819 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 973 aa  200  7.999999999999999e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  25.8 
 
 		 828 aa  199  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 803 aa  194  6e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 852 aa  189  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 748 aa  186  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  25.79 
 
 		 853 aa  182  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 804 aa  181  7e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  26.12 
 
 		 814 aa  174  5.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 812 aa  172  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  24.27 
 
 		 894 aa  171  5e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25.25 
 
 		 715 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  23.35 
 
 		 823 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0796  hypothetical protein  23.42 
 
 		 772 aa  127  9e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4518  TonB-dependent receptor  22.01 
 
 		 705 aa  112  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  30.58 
 
 		 810 aa  110  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 998 aa  107  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  29.89 
 
 		 961 aa  94.4  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  23.06 
 
 		 782 aa  94  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  24.51 
 
 		 926 aa  85.5  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  25.61 
 
 		 946 aa  79.7  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  26.06 
 
 		 929 aa  78.2  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  26.22 
 
 		 930 aa  75.1  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  28.26 
 
 		 952 aa  74.3  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2458  hypothetical protein  26.12 
 
 		 908 aa  70.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  26.8 
 
 		 924 aa  67.8  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1397  hypothetical protein  23.83 
 
 		 995 aa  64.3  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243953 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  23.74 
 
 		 915 aa  61.6  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  23.05 
 
 		 921 aa  61.6  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  24.9 
 
 		 891 aa  61.2  0.00000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 893 aa  60.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  25.83 
 
 		 904 aa  60.1  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  22.38 
 
 		 887 aa  59.3  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  23.13 
 
 		 972 aa  57.8  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 859 aa  56.6  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  24.16 
 
 		 747 aa  55.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  25.41 
 
 		 833 aa  54.3  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  32 
 
 		 838 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  27.55 
 
 		 748 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 917 aa  52.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  24.4 
 
 		 929 aa  52.4  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03327  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 862 aa  52.4  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  25.1 
 
 		 1066 aa  50.8  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 943 aa  50.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 920 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  27.7 
 
 		 919 aa  50.8  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 946 aa  50.4  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  24.23 
 
 		 1147 aa  50.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 836 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 798 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  26.61 
 
 		 907 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 1004 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  23.9 
 
 		 988 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 943 aa  48.1  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 938 aa  47.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>