More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03327 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03327  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 862 aa  1741    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1492  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 977 aa  206  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.442431 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 853 aa  203  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02733  TonB-dependent outer membrane receptor  25.72 
 
 		 897 aa  188  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  24.97 
 
 		 838 aa  165  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 836 aa  163  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 936 aa  163  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 842 aa  152  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 917 aa  151  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  23.41 
 
 		 945 aa  150  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 946 aa  147  9e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 942 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 927 aa  145  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2369  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 935 aa  141  4.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 938 aa  141  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 		 944 aa  140  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 948 aa  138  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 941 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 859 aa  134  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 951 aa  126  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  22.38 
 
 		 951 aa  126  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  22.35 
 
 		 868 aa  114  7.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  22.91 
 
 		 868 aa  114  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 919 aa  107  8e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 924 aa  106  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 		 929 aa  105  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 881 aa  102  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 931 aa  102  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4146  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 961 aa  103  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960595  normal  0.432652 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  30.5 
 
 		 972 aa  99  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0889  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  21.75 
 
 		 992 aa  97.4  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000114339  unclonable  0.0000000138215 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  23.13 
 
 		 933 aa  97.1  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 972 aa  95.5  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  23.22 
 
 		 887 aa  95.9  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  23.22 
 
 		 887 aa  95.5  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 914 aa  95.5  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 874 aa  95.1  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04688  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 918 aa  95.1  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 943 aa  94  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00302  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 746 aa  92.8  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0777336  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 901 aa  92  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  38.41 
 
 		 920 aa  92  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 943 aa  91.7  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1966  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 1240 aa  91.7  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00321927  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 957 aa  90.1  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  22.88 
 
 		 888 aa  89.4  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2652  3-dehydroquinate synthase  27.21 
 
 		 1210 aa  89  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000360118  normal  0.0199769 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  22.72 
 
 		 1006 aa  89  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  26.03 
 
 		 878 aa  89  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  26.03 
 
 		 878 aa  89  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  26.03 
 
 		 878 aa  88.2  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 888 aa  87.8  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  22.52 
 
 		 872 aa  87.8  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  25.73 
 
 		 878 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  34.73 
 
 		 934 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  33.15 
 
 		 919 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  31.28 
 
 		 947 aa  85.9  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 962 aa  85.9  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 926 aa  85.5  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 912 aa  85.1  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  39.39 
 
 		 943 aa  84.7  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 921 aa  84.3  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1716  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 1051 aa  84.3  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.854404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 894 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  33.54 
 
 		 1097 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  22.19 
 
 		 978 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 915 aa  82.4  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 951 aa  82  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2137  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 1013 aa  81.6  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255977  normal  0.143212 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 1036 aa  81.6  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 925 aa  81.3  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1838  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 979 aa  80.9  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.534381  hitchhiker  0.00298176 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 990 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 		 958 aa  79.7  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  31.87 
 
 		 875 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  33.53 
 
 		 934 aa  80.1  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  31.71 
 
 		 892 aa  79.3  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  32.52 
 
 		 1109 aa  79  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 918 aa  79  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 875 aa  78.6  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 880 aa  78.6  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  33.13 
 
 		 994 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 908 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 892 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  34.42 
 
 		 964 aa  76.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  23.86 
 
 		 908 aa  76.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 917 aa  75.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  25.32 
 
 		 968 aa  75.9  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  23.86 
 
 		 908 aa  76.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1075  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 601 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 958 aa  75.5  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  26.97 
 
 		 998 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 982 aa  75.5  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02336  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 889 aa  75.1  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0825116  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 982 aa  75.5  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 918 aa  74.7  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  24.48 
 
 		 927 aa  74.3  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  31.39 
 
 		 932 aa  74.3  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 885 aa  73.9  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  23.51 
 
 		 908 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>