223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1075 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_1075  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 601 aa  1237    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  99.16 
 
 		 892 aa  1216    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  39.9 
 
 		 880 aa  387  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  38.67 
 
 		 869 aa  378  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  37.99 
 
 		 874 aa  373  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  37.67 
 
 		 870 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  38.2 
 
 		 872 aa  368  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  37.58 
 
 		 888 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  38.5 
 
 		 874 aa  363  7.0000000000000005e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  37.52 
 
 		 874 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  36.17 
 
 		 887 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  36.17 
 
 		 887 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  35.99 
 
 		 881 aa  327  5e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  33.93 
 
 		 900 aa  310  4e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  33.39 
 
 		 882 aa  306  9.000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  34.36 
 
 		 845 aa  285  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  33.66 
 
 		 878 aa  274  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  33.66 
 
 		 878 aa  273  6e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  33.71 
 
 		 878 aa  273  7e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  33.5 
 
 		 878 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  31.56 
 
 		 859 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 		 892 aa  224  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 875 aa  208  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 875 aa  200  5e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 		 915 aa  185  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 868 aa  171  3e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 868 aa  169  1e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 902 aa  167  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 926 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 927 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 		 880 aa  158  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  30.33 
 
 		 881 aa  154  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 964 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  30.57 
 
 		 921 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 894 aa  145  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 918 aa  142  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  32.78 
 
 		 958 aa  142  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 912 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 914 aa  137  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 964 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 889 aa  135  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 994 aa  135  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 888 aa  132  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 993 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 1036 aa  130  8.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  33.23 
 
 		 947 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 958 aa  128  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 948 aa  127  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 933 aa  125  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 836 aa  125  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 931 aa  124  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 951 aa  124  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  32.52 
 
 		 908 aa  124  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  32.21 
 
 		 1109 aa  124  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 951 aa  124  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 951 aa  124  7e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 901 aa  123  8e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 929 aa  123  9e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 920 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 943 aa  122  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1279  rhodanese-like protein  29.24 
 
 		 990 aa  121  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000246729  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 1097 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 838 aa  120  6e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 901 aa  120  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  33.21 
 
 		 908 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1966  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 1240 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00321927  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 957 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 908 aa  119  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  33.1 
 
 		 908 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  33.1 
 
 		 908 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 946 aa  118  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 978 aa  118  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2720  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 1009 aa  118  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.000000258905  normal  0.119134 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 945 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2652  3-dehydroquinate synthase  29.09 
 
 		 1210 aa  117  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000360118  normal  0.0199769 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 1047 aa  117  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 934 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 984 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  31.75 
 
 		 885 aa  116  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  32.74 
 
 		 908 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 1011 aa  114  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 967 aa  114  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 921 aa  113  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 906 aa  110  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  24.8 
 
 		 986 aa  108  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 961 aa  107  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 904 aa  106  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 925 aa  106  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  25.46 
 
 		 919 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 923 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0887  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 1236 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00309149  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 984 aa  106  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 936 aa  106  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  28.88 
 
 		 972 aa  105  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  27.79 
 
 		 838 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  30.52 
 
 		 976 aa  103  8e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 945 aa  102  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 917 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  26.27 
 
 		 959 aa  102  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 994 aa  101  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>