293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2735 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  46.6 
 
 		 908 aa  766    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  46.37 
 
 		 908 aa  766    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 921 aa  1863    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  46.74 
 
 		 908 aa  738    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  50.37 
 
 		 919 aa  865    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  42.9 
 
 		 911 aa  658    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  46.04 
 
 		 908 aa  751    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  46.49 
 
 		 908 aa  763    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  45.57 
 
 		 906 aa  725    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0866  TonB-dependent receptor  44.74 
 
 		 924 aa  726    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  39.21 
 
 		 906 aa  607  9.999999999999999e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  38.79 
 
 		 945 aa  575  1.0000000000000001e-162  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  36.41 
 
 		 938 aa  531  1e-149  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  37.16 
 
 		 918 aa  524  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  35.84 
 
 		 946 aa  520  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  36.06 
 
 		 943 aa  514  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1938  TonB-dependent receptor  34.69 
 
 		 971 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886775  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02628  TonB-dependent receptor  34.76 
 
 		 967 aa  445  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3818  TonB-dependent receptor  33.14 
 
 		 974 aa  444  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.003378  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  30.57 
 
 		 942 aa  364  4e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 1007 aa  357  5.999999999999999e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  30.47 
 
 		 940 aa  356  1e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 939 aa  350  8e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 939 aa  350  9e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 940 aa  347  4e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 908 aa  347  6e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 885 aa  345  2e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  30.43 
 
 		 941 aa  344  5.999999999999999e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 976 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  30.03 
 
 		 960 aa  335  2e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 921 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 912 aa  332  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 988 aa  332  2e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 988 aa  328  3e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 1010 aa  323  6e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 1016 aa  313  1e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  29.92 
 
 		 959 aa  296  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  30.12 
 
 		 836 aa  290  9e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 961 aa  253  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 901 aa  246  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 904 aa  246  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 894 aa  229  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  26.44 
 
 		 970 aa  228  5.0000000000000005e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 918 aa  226  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 915 aa  226  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  26.94 
 
 		 878 aa  222  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  26.94 
 
 		 878 aa  221  6e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  26.84 
 
 		 878 aa  219  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 927 aa  219  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  26.84 
 
 		 878 aa  219  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 859 aa  218  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 948 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 892 aa  215  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 875 aa  213  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 929 aa  213  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 951 aa  209  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 951 aa  209  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 951 aa  208  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 931 aa  206  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 918 aa  205  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 914 aa  204  8e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 892 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0253  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 1011 aa  197  7e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0016718  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 994 aa  196  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 881 aa  197  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  26.08 
 
 		 968 aa  195  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 934 aa  189  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2991  hypothetical protein  23.71 
 
 		 1013 aa  189  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000283322  hitchhiker  0.000000325565 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 875 aa  189  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 958 aa  188  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  25.77 
 
 		 927 aa  188  5e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 872 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 874 aa  185  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 957 aa  185  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 874 aa  184  7e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 888 aa  183  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 868 aa  181  4e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 919 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  22.97 
 
 		 942 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 868 aa  181  5.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2065  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 963 aa  180  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 941 aa  180  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2242  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 950 aa  179  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 1074 aa  178  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 924 aa  178  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  22.98 
 
 		 944 aa  177  7e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 933 aa  176  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 838 aa  176  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 874 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  22.68 
 
 		 917 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1386  hypothetical protein  24.24 
 
 		 1046 aa  171  8e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000408374  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 943 aa  170  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  24.04 
 
 		 947 aa  170  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4482  hypothetical protein  45.92 
 
 		 312 aa  170  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  23.41 
 
 		 836 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 888 aa  167  9e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 936 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 936 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 845 aa  164  8.000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3698  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 961 aa  157  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>