227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2065 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2065  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 963 aa  1973    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2991  hypothetical protein  38.67 
 
 		 1013 aa  608  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000283322  hitchhiker  0.000000325565 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0253  TonB-dependent receptor  38.24 
 
 		 1011 aa  568  1e-160  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0016718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  33.13 
 
 		 970 aa  511  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1386  hypothetical protein  31.18 
 
 		 1046 aa  451  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000408374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  25.53 
 
 		 908 aa  254  6e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 908 aa  253  8.000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  25 
 
 		 960 aa  247  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 1007 aa  239  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 951 aa  233  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 951 aa  232  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 988 aa  231  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 988 aa  231  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 951 aa  230  8e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 904 aa  224  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  26.72 
 
 		 940 aa  224  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 885 aa  223  9e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 908 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  24.85 
 
 		 908 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 939 aa  220  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 1010 aa  219  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 906 aa  219  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 939 aa  219  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  24.52 
 
 		 908 aa  218  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 940 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 908 aa  215  3.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  26.07 
 
 		 942 aa  212  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  25.96 
 
 		 941 aa  212  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  25.37 
 
 		 959 aa  211  4e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 906 aa  211  4e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 948 aa  205  4e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 912 aa  201  5e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 921 aa  201  5e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  24.46 
 
 		 919 aa  199  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 943 aa  197  7e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 914 aa  196  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 901 aa  195  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 945 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 927 aa  187  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 869 aa  187  7e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 945 aa  187  8e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 922 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  23.01 
 
 		 961 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  26.27 
 
 		 836 aa  184  7e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 880 aa  184  7e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 870 aa  184  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 872 aa  181  7e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 934 aa  180  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 978 aa  179  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 880 aa  179  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  23.38 
 
 		 921 aa  179  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 888 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0866  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 924 aa  176  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 958 aa  172  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 936 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 874 aa  168  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 936 aa  168  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 874 aa  167  9e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 929 aa  166  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 881 aa  164  6e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 		 984 aa  156  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  22.27 
 
 		 919 aa  155  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 1035 aa  154  8.999999999999999e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  23.06 
 
 		 924 aa  152  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  23.19 
 
 		 964 aa  151  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1838  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 979 aa  151  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.534381  hitchhiker  0.00298176 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  23.23 
 
 		 944 aa  150  8e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 993 aa  150  8e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  24.33 
 
 		 978 aa  150  8e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 945 aa  150  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 1013 aa  148  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  34.46 
 
 		 918 aa  146  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 958 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  24.48 
 
 		 998 aa  142  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  24.35 
 
 		 998 aa  141  7e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 1011 aa  139  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 888 aa  139  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  40.61 
 
 		 976 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2242  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 950 aa  137  9e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  22.93 
 
 		 845 aa  137  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 1016 aa  137  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 911 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 894 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 		 926 aa  135  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  22.8 
 
 		 906 aa  133  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  23.5 
 
 		 838 aa  132  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  22.63 
 
 		 920 aa  132  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4482  hypothetical protein  31.45 
 
 		 312 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2369  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 935 aa  129  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 1036 aa  128  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 915 aa  125  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1843  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 1083 aa  124  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  unclonable  0.0000000198025  decreased coverage  0.000327731 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2831  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 1017 aa  123  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312768  hitchhiker  0.00196838 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02198  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 1048 aa  120  9e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 936 aa  120  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  23.84 
 
 		 878 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  24.03 
 
 		 878 aa  119  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  23.84 
 
 		 878 aa  119  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  23.95 
 
 		 998 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  23.66 
 
 		 878 aa  118  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>