More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2209 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  41.02 
 
 		 946 aa  671    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  77.02 
 
 		 908 aa  1426    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  100 
 
 		 908 aa  1851    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  45.25 
 
 		 919 aa  721    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0866  TonB-dependent receptor  42.94 
 
 		 924 aa  679    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  79.71 
 
 		 908 aa  1454    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  78.42 
 
 		 906 aa  1422    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  77.02 
 
 		 908 aa  1426    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  41.03 
 
 		 938 aa  664    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  46.4 
 
 		 921 aa  738    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  77.13 
 
 		 908 aa  1427    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  40.62 
 
 		 945 aa  642    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  41.3 
 
 		 911 aa  629  1e-179  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  37.9 
 
 		 906 aa  593  1e-168  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02628  TonB-dependent receptor  36.94 
 
 		 967 aa  554  1e-156  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  38.91 
 
 		 918 aa  546  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  36.27 
 
 		 943 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1938  TonB-dependent receptor  35.92 
 
 		 971 aa  535  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886775  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3818  TonB-dependent receptor  35.92 
 
 		 974 aa  532  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.003378  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  33.98 
 
 		 941 aa  450  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  34.04 
 
 		 939 aa  452  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  34.04 
 
 		 939 aa  452  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  34.11 
 
 		 940 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  33.57 
 
 		 940 aa  436  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  32.95 
 
 		 1007 aa  430  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  33.47 
 
 		 942 aa  419  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  33.27 
 
 		 988 aa  416  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  33.27 
 
 		 988 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  35.12 
 
 		 976 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  31.63 
 
 		 960 aa  398  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  31.92 
 
 		 1010 aa  398  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  31.75 
 
 		 1016 aa  391  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 		 912 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  31.78 
 
 		 921 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  31.76 
 
 		 908 aa  375  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  33.53 
 
 		 836 aa  369  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 885 aa  357  3.9999999999999996e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  29.8 
 
 		 959 aa  333  6e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 901 aa  301  3e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 961 aa  300  8e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 894 aa  290  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 915 aa  288  5e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 904 aa  281  6e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 951 aa  278  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 951 aa  276  9e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 951 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 948 aa  259  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 958 aa  258  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 1097 aa  257  7e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2065  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 963 aa  256  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  28.03 
 
 		 1109 aa  255  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  26.74 
 
 		 970 aa  248  4.9999999999999997e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 934 aa  242  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  27.33 
 
 		 878 aa  240  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  27.14 
 
 		 878 aa  239  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  27.23 
 
 		 878 aa  238  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  27.23 
 
 		 878 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 943 aa  235  3e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 859 aa  224  7e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 922 aa  220  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4482  hypothetical protein  43.05 
 
 		 312 aa  220  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 918 aa  219  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 914 aa  214  4.9999999999999996e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 994 aa  211  5e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 892 aa  210  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 990 aa  206  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 919 aa  204  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 888 aa  202  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 1074 aa  201  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 967 aa  201  6e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 945 aa  201  7.999999999999999e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  24.66 
 
 		 986 aa  200  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 927 aa  198  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 978 aa  198  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  25.83 
 
 		 998 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  25.83 
 
 		 998 aa  198  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  25.74 
 
 		 998 aa  197  7e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 875 aa  197  7e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 957 aa  196  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 880 aa  196  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  26.19 
 
 		 998 aa  196  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 869 aa  196  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 868 aa  195  3e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 868 aa  194  6e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 934 aa  193  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 924 aa  192  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 964 aa  191  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0253  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 1011 aa  191  5e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0016718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 920 aa  191  5e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 923 aa  191  5e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 984 aa  190  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 982 aa  185  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 982 aa  185  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  24.85 
 
 		 927 aa  185  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 838 aa  182  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 887 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 887 aa  181  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 994 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 881 aa  181  7e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 945 aa  179  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>