222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02628 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  42.38 
 
 		 946 aa  730    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1938  TonB-dependent receptor  74.38 
 
 		 971 aa  1462    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886775  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3818  TonB-dependent receptor  71.05 
 
 		 974 aa  1417    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.003378  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  44.89 
 
 		 938 aa  777    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02628  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 967 aa  1952    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  37.12 
 
 		 906 aa  546  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  36.61 
 
 		 908 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  36.61 
 
 		 908 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  36.94 
 
 		 908 aa  542  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  36.51 
 
 		 908 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  37.3 
 
 		 908 aa  532  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  33.72 
 
 		 919 aa  450  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  35.31 
 
 		 921 aa  430  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  33.02 
 
 		 911 aa  390  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  32.45 
 
 		 918 aa  387  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0866  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 924 aa  384  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 906 aa  372  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 945 aa  365  2e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 943 aa  327  8.000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 939 aa  304  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 939 aa  304  7.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  29.4 
 
 		 941 aa  300  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  28.78 
 
 		 940 aa  289  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 940 aa  286  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  27.39 
 
 		 959 aa  276  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 1010 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 988 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 988 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  27.61 
 
 		 942 aa  271  4e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 976 aa  271  5e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  29.29 
 
 		 836 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 1007 aa  260  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 1016 aa  260  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  26.45 
 
 		 960 aa  253  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 885 aa  250  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 908 aa  243  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  27.42 
 
 		 1109 aa  231  7e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 904 aa  229  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 958 aa  226  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 961 aa  226  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 1097 aa  224  8e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 901 aa  220  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  27.13 
 
 		 878 aa  217  7e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 		 878 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  27.13 
 
 		 878 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 		 878 aa  215  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 967 aa  215  3.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 943 aa  213  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 982 aa  212  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 982 aa  212  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 919 aa  211  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 945 aa  204  5e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 1013 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 920 aa  197  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  25.18 
 
 		 998 aa  193  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  25.17 
 
 		 998 aa  188  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 924 aa  188  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  25.17 
 
 		 998 aa  187  8e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  25.07 
 
 		 998 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 923 aa  186  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 859 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  25.83 
 
 		 978 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 882 aa  184  6e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 951 aa  184  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 918 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 958 aa  181  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 951 aa  181  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 964 aa  181  8e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 951 aa  181  8e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 948 aa  177  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 990 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 892 aa  174  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 880 aa  174  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 894 aa  173  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 934 aa  172  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 881 aa  171  6e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 900 aa  170  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4482  hypothetical protein  35.27 
 
 		 312 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 869 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 875 aa  162  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 934 aa  155  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1125  TonB-dependent receptor plug  24.47 
 
 		 944 aa  154  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 936 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 936 aa  152  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4006  TonB-dependent receptor  35.06 
 
 		 984 aa  143  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000010552  normal  0.168301 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  31.11 
 
 		 986 aa  142  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 945 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  21.89 
 
 		 1074 aa  139  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 921 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 994 aa  134  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 912 aa  134  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 1011 aa  129  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  29.63 
 
 		 970 aa  129  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  31.02 
 
 		 964 aa  125  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 944 aa  125  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  34.56 
 
 		 845 aa  124  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2831  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 1017 aa  124  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312768  hitchhiker  0.00196838 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 915 aa  123  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2142  TonB-dependent receptor  32.06 
 
 		 1034 aa  124  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0000142845  normal  0.0159239 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 998 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>