More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1021 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 845 aa  1722    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  39.38 
 
 		 892 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  38.9 
 
 		 859 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  37.17 
 
 		 874 aa  491  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  35.08 
 
 		 878 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  35.2 
 
 		 878 aa  482  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  35.08 
 
 		 878 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  35.08 
 
 		 878 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  36.17 
 
 		 869 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  36.48 
 
 		 888 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  36.08 
 
 		 870 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  35.98 
 
 		 874 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  36.29 
 
 		 872 aa  464  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  35.86 
 
 		 874 aa  456  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  34.33 
 
 		 882 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  34.78 
 
 		 887 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  34.06 
 
 		 900 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  34.78 
 
 		 887 aa  446  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  34.55 
 
 		 880 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  34.21 
 
 		 881 aa  433  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  35.46 
 
 		 892 aa  420  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  34.31 
 
 		 875 aa  397  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  32.47 
 
 		 927 aa  371  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  31.04 
 
 		 875 aa  335  2e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 		 894 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 915 aa  325  2e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 964 aa  317  5e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 964 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  31.16 
 
 		 868 aa  311  2.9999999999999997e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 		 868 aa  310  5.9999999999999995e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 926 aa  298  4e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 902 aa  295  4e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1075  TonB-dependent receptor  33.93 
 
 		 601 aa  293  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 1036 aa  289  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 951 aa  274  6e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 951 aa  273  7e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 951 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 889 aa  261  6e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  26.28 
 
 		 1109 aa  247  6e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 885 aa  240  6.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 908 aa  236  9e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 961 aa  234  5e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 958 aa  234  7.000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  25.95 
 
 		 940 aa  227  7e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 940 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 939 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  26.5 
 
 		 941 aa  221  5e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 939 aa  220  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  26.67 
 
 		 942 aa  217  8e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1072  TonB-dependent receptor, plug  56.89 
 
 		 271 aa  211  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 1006 aa  209  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  26.22 
 
 		 906 aa  209  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 1007 aa  206  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  25.9 
 
 		 919 aa  197  7e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 1074 aa  191  5e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  27 
 
 		 836 aa  191  5.999999999999999e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  25.93 
 
 		 960 aa  191  5.999999999999999e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 944 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 984 aa  186  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 901 aa  186  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 938 aa  186  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 945 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 990 aa  182  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 936 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 838 aa  180  8e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  25.87 
 
 		 959 aa  180  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3698  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 961 aa  178  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 942 aa  177  9e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 924 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 941 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 944 aa  174  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  38.12 
 
 		 1013 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  47.25 
 
 		 1047 aa  174  7.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 987 aa  173  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 1016 aa  172  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 943 aa  169  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  37.14 
 
 		 943 aa  169  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 853 aa  167  5.9999999999999996e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 880 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  37.23 
 
 		 978 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  35.95 
 
 		 990 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  35.53 
 
 		 1097 aa  164  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  34.58 
 
 		 929 aa  157  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  35.99 
 
 		 986 aa  156  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  32.71 
 
 		 967 aa  155  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  37.77 
 
 		 998 aa  155  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  36.84 
 
 		 998 aa  153  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  35.91 
 
 		 998 aa  152  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  35.91 
 
 		 998 aa  152  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  36.13 
 
 		 948 aa  151  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  34.75 
 
 		 958 aa  151  6e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3939  TonB-dependent receptor  38.18 
 
 		 1017 aa  150  7e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.719926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 1008 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  35.64 
 
 		 1011 aa  149  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  32.83 
 
 		 998 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  35.4 
 
 		 919 aa  147  6e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  36.23 
 
 		 914 aa  147  7.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2065  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 963 aa  147  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 		 918 aa  145  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  33.97 
 
 		 982 aa  145  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>