More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3426 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 902 aa  1843    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  34.14 
 
 		 927 aa  445  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 		 875 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  33.12 
 
 		 859 aa  393  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  30.98 
 
 		 892 aa  378  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  31.32 
 
 		 875 aa  379  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 		 868 aa  354  4e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 889 aa  352  3e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  31.33 
 
 		 868 aa  350  7e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 874 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 869 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 		 926 aa  310  9e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 870 aa  310  1.0000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  29.99 
 
 		 872 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 874 aa  301  4e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 888 aa  298  4e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  29.99 
 
 		 880 aa  293  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 892 aa  292  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 874 aa  290  8e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 1047 aa  289  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 845 aa  288  4e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 887 aa  287  5e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 881 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 900 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 887 aa  283  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 964 aa  281  5e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 882 aa  275  3e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 1036 aa  268  2.9999999999999995e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 964 aa  252  3e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 894 aa  241  5e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 951 aa  233  9e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 951 aa  231  6e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 951 aa  230  7e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  24.85 
 
 		 1109 aa  228  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 915 aa  222  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 943 aa  222  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 1097 aa  222  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 958 aa  221  3.9999999999999997e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 918 aa  215  2.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  26.47 
 
 		 978 aa  208  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  26.39 
 
 		 927 aa  206  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 885 aa  206  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 945 aa  201  7e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 904 aa  199  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 934 aa  198  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 922 aa  197  6e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 921 aa  196  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 918 aa  196  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 912 aa  194  7e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 967 aa  192  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3318  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  25.13 
 
 		 954 aa  191  7e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0120017  decreased coverage  0.00000382692 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 924 aa  189  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2242  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 950 aa  189  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 945 aa  189  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 936 aa  188  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 936 aa  189  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 920 aa  188  5e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 958 aa  182  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 931 aa  177  7e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 944 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 1006 aa  174  7.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 878 aa  172  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  25.56 
 
 		 998 aa  172  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 878 aa  172  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  25.67 
 
 		 998 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 878 aa  172  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 878 aa  171  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  25.56 
 
 		 998 aa  171  6e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  24.89 
 
 		 906 aa  168  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1075  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 601 aa  164  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 994 aa  162  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 838 aa  160  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  24.85 
 
 		 908 aa  159  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 990 aa  159  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2831  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 1017 aa  159  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312768  hitchhiker  0.00196838 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 940 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 939 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 939 aa  151  6e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 914 aa  150  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  24.28 
 
 		 940 aa  148  5e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  24.62 
 
 		 941 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1072  TonB-dependent receptor, plug  41.18 
 
 		 271 aa  147  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1125  TonB-dependent receptor plug  25.2 
 
 		 944 aa  147  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 		 1016 aa  147  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 906 aa  144  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  24.77 
 
 		 836 aa  144  8e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 994 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  23.42 
 
 		 960 aa  139  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 976 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 934 aa  138  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  24.56 
 
 		 942 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 1007 aa  137  8e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1279  rhodanese-like protein  24.42 
 
 		 990 aa  137  8e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000246729  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 990 aa  135  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 982 aa  135  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 982 aa  135  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 938 aa  134  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 923 aa  134  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02198  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 1048 aa  134  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  31.99 
 
 		 1011 aa  133  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>