More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3658 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 894 aa  1821    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  36.23 
 
 		 915 aa  469  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  31.87 
 
 		 951 aa  371  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  31.77 
 
 		 951 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  31.87 
 
 		 951 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  31.97 
 
 		 958 aa  363  9e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  31.64 
 
 		 878 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  31.46 
 
 		 878 aa  353  1e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  31.35 
 
 		 878 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  31.35 
 
 		 878 aa  350  6e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 875 aa  347  8e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  31.69 
 
 		 1097 aa  342  1e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  31.08 
 
 		 919 aa  343  1e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  30.98 
 
 		 892 aa  340  7e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  31.52 
 
 		 943 aa  336  1e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  31.57 
 
 		 914 aa  334  4e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  30.57 
 
 		 931 aa  332  1e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 		 948 aa  331  3e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 875 aa  331  3e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 934 aa  330  7e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 929 aa  325  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 872 aa  324  4e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 874 aa  319  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  30.76 
 
 		 870 aa  318  3e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 927 aa  318  4e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  31.55 
 
 		 845 aa  314  3.9999999999999997e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 868 aa  310  5.9999999999999995e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 994 aa  310  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 868 aa  309  1.0000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 888 aa  309  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 921 aa  307  6e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 869 aa  307  7e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 880 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 887 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 874 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 887 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  28.95 
 
 		 906 aa  303  7.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 993 aa  303  9e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 912 aa  301  3e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 900 aa  300  5e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 888 aa  301  5e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 874 aa  300  6e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  29.39 
 
 		 927 aa  300  7e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 882 aa  299  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 967 aa  298  4e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 908 aa  296  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 926 aa  296  1e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 881 aa  295  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  27.96 
 
 		 908 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  27.75 
 
 		 908 aa  294  4e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 906 aa  294  5e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 908 aa  294  6e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  27.88 
 
 		 908 aa  290  9e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 885 aa  286  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 880 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 957 aa  284  5.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 892 aa  284  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 958 aa  283  8.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  28.28 
 
 		 941 aa  283  9e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 1047 aa  283  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 924 aa  282  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 939 aa  282  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 940 aa  281  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 922 aa  281  5e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  28.6 
 
 		 939 aa  280  8e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  28.4 
 
 		 942 aa  275  3e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 936 aa  274  7e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 908 aa  273  8.000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 936 aa  273  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 920 aa  271  4e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 933 aa  270  5.9999999999999995e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 976 aa  270  7e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  27.7 
 
 		 940 aa  270  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  26.32 
 
 		 998 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 925 aa  268  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 998 aa  266  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 1008 aa  265  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 881 aa  265  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 1074 aa  264  6e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 1036 aa  264  6.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  26.85 
 
 		 998 aa  262  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  26.71 
 
 		 998 aa  262  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  26.8 
 
 		 998 aa  262  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 		 947 aa  261  5.0000000000000005e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 945 aa  258  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 904 aa  256  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 1007 aa  256  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  27.14 
 
 		 978 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 944 aa  253  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 901 aa  251  4e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 917 aa  250  8e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 853 aa  244  3.9999999999999997e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 906 aa  243  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 836 aa  243  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 946 aa  238  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 902 aa  238  5.0000000000000005e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 944 aa  238  6e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 838 aa  237  6e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 911 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 941 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>