230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2085 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  47.06 
 
 		 922 aa  814    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  81.88 
 
 		 944 aa  1618    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  49.18 
 
 		 927 aa  903    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3318  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  46.6 
 
 		 954 aa  829    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0120017  decreased coverage  0.00000382692 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  70.07 
 
 		 936 aa  1297    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  70.18 
 
 		 936 aa  1298    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2242  TonB-dependent receptor  43.66 
 
 		 950 aa  777    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 945 aa  1930    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 918 aa  332  2e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 881 aa  316  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 880 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 951 aa  269  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 951 aa  268  5e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  27.36 
 
 		 968 aa  266  1e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 951 aa  265  3e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 1097 aa  255  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 894 aa  254  5.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 958 aa  246  9.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 943 aa  242  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 948 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 994 aa  224  6e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 915 aa  223  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 859 aa  217  7e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 945 aa  217  7e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2720  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 1009 aa  217  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.000000258905  normal  0.119134 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 934 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 961 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 927 aa  214  9e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 914 aa  211  5e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 993 aa  209  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 880 aa  209  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 869 aa  205  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 870 aa  204  5e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 868 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  26.15 
 
 		 878 aa  202  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  25.97 
 
 		 878 aa  201  5e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  25.97 
 
 		 878 aa  201  5e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 875 aa  201  6e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 868 aa  201  7e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  25.97 
 
 		 878 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 900 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 882 aa  199  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 875 aa  199  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 912 aa  197  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 902 aa  196  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 921 aa  193  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 887 aa  192  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 887 aa  192  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 926 aa  192  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 892 aa  192  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  25.83 
 
 		 908 aa  192  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 908 aa  190  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 919 aa  190  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 964 aa  189  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  25.9 
 
 		 908 aa  189  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2065  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 963 aa  189  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  24.74 
 
 		 970 aa  186  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 872 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 920 aa  185  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  25.7 
 
 		 908 aa  184  8.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 		 874 aa  183  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 881 aa  182  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 845 aa  180  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 976 aa  179  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 885 aa  179  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  25.37 
 
 		 918 aa  177  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 888 aa  177  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  25.09 
 
 		 998 aa  177  8e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3650  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 1012 aa  174  9e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000400327  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  25.27 
 
 		 906 aa  173  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  23.18 
 
 		 941 aa  168  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 988 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 		 988 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  23.38 
 
 		 960 aa  166  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 918 aa  166  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  23.23 
 
 		 939 aa  165  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  23.23 
 
 		 939 aa  164  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 1035 aa  163  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  30.8 
 
 		 994 aa  164  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 990 aa  162  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 1036 aa  162  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  23.8 
 
 		 942 aa  161  7e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 917 aa  160  8e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 1007 aa  159  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 944 aa  160  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  23.19 
 
 		 942 aa  159  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  23.07 
 
 		 940 aa  159  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  22.94 
 
 		 941 aa  157  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 889 aa  155  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  24.15 
 
 		 919 aa  155  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 1010 aa  155  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 901 aa  154  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 938 aa  154  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 943 aa  152  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  36.19 
 
 		 958 aa  153  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 987 aa  152  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  22.43 
 
 		 940 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  23.69 
 
 		 838 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 901 aa  150  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2137  TonB-dependent receptor  32.93 
 
 		 1013 aa  149  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255977  normal  0.143212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>