260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2137 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2142  TonB-dependent receptor  39 
 
 		 1034 aa  658    Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0000142845  normal  0.0159239 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2137  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1013 aa  2074    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255977  normal  0.143212 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1865  TonB-dependent receptor  99.65 
 
 		 573 aa  1173    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4006  TonB-dependent receptor  36.83 
 
 		 984 aa  604  1.0000000000000001e-171  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000010552  normal  0.168301 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3939  TonB-dependent receptor  35.1 
 
 		 1017 aa  543  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.719926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2542  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 1048 aa  385  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000765383  decreased coverage  0.00000552533 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 957 aa  246  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 931 aa  242  2.9999999999999997e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 978 aa  239  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 922 aa  237  7e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 914 aa  219  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 881 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  26.47 
 
 		 940 aa  204  8e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 939 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 939 aa  198  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  26.12 
 
 		 941 aa  195  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  25.46 
 
 		 906 aa  185  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 921 aa  177  7e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 984 aa  177  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 912 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 987 aa  170  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 1035 aa  166  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 1010 aa  165  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  23.82 
 
 		 959 aa  161  5e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 1007 aa  159  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1843  TonB-dependent receptor  35.1 
 
 		 1083 aa  159  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  unclonable  0.0000000198025  decreased coverage  0.000327731 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3318  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  33.02 
 
 		 954 aa  153  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0120017  decreased coverage  0.00000382692 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1093  TonB-dependent receptor  36.91 
 
 		 1158 aa  151  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000168671  normal  0.12204 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02198  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 1048 aa  151  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  32.33 
 
 		 944 aa  151  7e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  33.56 
 
 		 945 aa  147  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  30.97 
 
 		 927 aa  146  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  31.73 
 
 		 936 aa  146  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  36 
 
 		 958 aa  145  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  33.54 
 
 		 1109 aa  145  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  31.47 
 
 		 936 aa  144  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  32.21 
 
 		 948 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  32.27 
 
 		 951 aa  142  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 859 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  32 
 
 		 951 aa  141  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 894 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 927 aa  140  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  32 
 
 		 951 aa  140  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  32.53 
 
 		 968 aa  138  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  31.99 
 
 		 958 aa  137  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  34.1 
 
 		 933 aa  137  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 		 906 aa  135  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  31.87 
 
 		 964 aa  135  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  31.59 
 
 		 961 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 943 aa  135  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2242  TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 950 aa  135  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  35.67 
 
 		 990 aa  134  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 1047 aa  133  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  38.5 
 
 		 880 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  37.87 
 
 		 986 aa  132  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  38.61 
 
 		 881 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 929 aa  130  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  34.69 
 
 		 874 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  31.29 
 
 		 964 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  38.24 
 
 		 870 aa  129  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  39.68 
 
 		 887 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  36.8 
 
 		 918 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 875 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 1036 aa  128  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  39.02 
 
 		 874 aa  128  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 915 aa  127  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  31.74 
 
 		 1097 aa  128  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  38.24 
 
 		 869 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 993 aa  127  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  39.15 
 
 		 887 aa  127  9e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  37.22 
 
 		 900 aa  127  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  30.14 
 
 		 918 aa  126  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 919 aa  126  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2720  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 1009 aa  126  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.000000258905  normal  0.119134 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  37.56 
 
 		 874 aa  125  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 934 aa  124  8e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  36.67 
 
 		 892 aa  124  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 902 aa  124  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  31.23 
 
 		 967 aa  124  9e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  36.59 
 
 		 888 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  34.5 
 
 		 920 aa  124  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  35.75 
 
 		 882 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  37.07 
 
 		 872 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  29.37 
 
 		 919 aa  124  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  30.84 
 
 		 868 aa  123  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 924 aa  122  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 918 aa  122  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  41.45 
 
 		 892 aa  122  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 998 aa  121  7e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 998 aa  121  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 868 aa  120  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  29.21 
 
 		 960 aa  120  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 998 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  31.71 
 
 		 994 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  31.92 
 
 		 875 aa  120  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 880 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1072  TonB-dependent receptor, plug  39.81 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  31.83 
 
 		 1006 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 1016 aa  119  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2831  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 		 1017 aa  119  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312768  hitchhiker  0.00196838 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>