275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1074 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  77.23 
 
 		 874 aa  1392    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  92.91 
 
 		 888 aa  1659    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  88.1 
 
 		 874 aa  1587    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  70.93 
 
 		 870 aa  1254    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  48.61 
 
 		 900 aa  823    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  49.72 
 
 		 881 aa  834    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 872 aa  1782    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  63.77 
 
 		 880 aa  1117    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  45.08 
 
 		 892 aa  659    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  48.72 
 
 		 882 aa  824    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  50.17 
 
 		 887 aa  846    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  70.86 
 
 		 869 aa  1256    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  51.17 
 
 		 887 aa  852    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  91.53 
 
 		 874 aa  1635    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  36.39 
 
 		 845 aa  453  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  35.1 
 
 		 892 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  34.53 
 
 		 878 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  34.53 
 
 		 878 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  34.53 
 
 		 878 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  34.42 
 
 		 878 aa  412  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  32.85 
 
 		 859 aa  397  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 927 aa  383  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1075  TonB-dependent receptor  37.87 
 
 		 601 aa  363  8e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 875 aa  353  5.9999999999999994e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 875 aa  351  4e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  32.23 
 
 		 868 aa  342  2e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  32.19 
 
 		 868 aa  341  2.9999999999999998e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 894 aa  326  1e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 964 aa  326  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 926 aa  322  1.9999999999999998e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 964 aa  321  3e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 915 aa  308  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  29.99 
 
 		 902 aa  307  5.0000000000000004e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1072  TonB-dependent receptor, plug  65.16 
 
 		 271 aa  281  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 889 aa  274  5.000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 945 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 918 aa  252  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 961 aa  248  3e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 920 aa  248  4.9999999999999997e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 924 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 929 aa  222  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  26.42 
 
 		 947 aa  215  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 921 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 912 aa  211  5e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 881 aa  205  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 933 aa  205  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 936 aa  194  7e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 936 aa  194  8e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 838 aa  186  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 945 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 885 aa  185  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 921 aa  182  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 993 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 901 aa  180  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  24.51 
 
 		 959 aa  179  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  26.78 
 
 		 908 aa  179  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 908 aa  178  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2065  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 963 aa  177  8e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 945 aa  176  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  45.41 
 
 		 1047 aa  176  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 836 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  26.37 
 
 		 908 aa  174  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  37.92 
 
 		 934 aa  172  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  35.37 
 
 		 1036 aa  172  4e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  33.24 
 
 		 943 aa  171  7e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  34.84 
 
 		 1109 aa  165  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2242  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 950 aa  164  8.000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3939  TonB-dependent receptor  43.56 
 
 		 1017 aa  162  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.719926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  34.38 
 
 		 967 aa  162  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  37.77 
 
 		 958 aa  161  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  35.05 
 
 		 1097 aa  160  7e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  32.4 
 
 		 919 aa  160  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  34.04 
 
 		 998 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 842 aa  155  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  34.04 
 
 		 998 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 1013 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  34.04 
 
 		 998 aa  155  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  38.37 
 
 		 998 aa  155  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  36.47 
 
 		 1008 aa  153  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  32.35 
 
 		 982 aa  153  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  32.35 
 
 		 982 aa  153  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  36.3 
 
 		 951 aa  152  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  33.23 
 
 		 998 aa  152  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  23.33 
 
 		 838 aa  151  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  33.22 
 
 		 990 aa  151  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  36.67 
 
 		 951 aa  151  5e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  36.67 
 
 		 951 aa  151  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  41.26 
 
 		 914 aa  150  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  23.29 
 
 		 917 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  34.93 
 
 		 978 aa  147  6e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 1074 aa  146  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 994 aa  142  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  32.9 
 
 		 948 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2126  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 986 aa  142  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.593846  normal  0.258054 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 923 aa  142  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  37.07 
 
 		 1006 aa  142  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 880 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  31.02 
 
 		 957 aa  141  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  37.14 
 
 		 990 aa  140  8.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 1035 aa  140  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>