288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3520 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  58.7 
 
 		 929 aa  1054    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  55.44 
 
 		 931 aa  1044    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 957 aa  1955    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  40.35 
 
 		 918 aa  625  1e-177  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  33.64 
 
 		 906 aa  429  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 933 aa  339  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 894 aa  281  5e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 1097 aa  267  8e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 958 aa  259  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 859 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 892 aa  253  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2137  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 1013 aa  253  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255977  normal  0.143212 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 951 aa  248  4e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 951 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 951 aa  245  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 915 aa  236  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 920 aa  235  4.0000000000000004e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 948 aa  230  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 925 aa  228  5.0000000000000005e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 945 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 875 aa  219  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 924 aa  213  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 908 aa  207  6e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  26.61 
 
 		 908 aa  207  8e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  26.99 
 
 		 908 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 923 aa  206  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 922 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 976 aa  199  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  24.85 
 
 		 908 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 881 aa  191  7e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 1074 aa  191  7e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 940 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 918 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 885 aa  181  7e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  24.48 
 
 		 940 aa  180  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 939 aa  180  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 984 aa  179  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 939 aa  179  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  24.35 
 
 		 942 aa  178  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  24.53 
 
 		 941 aa  178  5e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 904 aa  177  8e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 921 aa  175  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 994 aa  175  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  24.55 
 
 		 998 aa  174  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 901 aa  172  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 1035 aa  171  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  34.54 
 
 		 1006 aa  171  8e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 908 aa  168  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  37.8 
 
 		 927 aa  168  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  37.46 
 
 		 987 aa  167  8e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03867  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 977 aa  167  9e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 943 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2720  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 1009 aa  166  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.000000258905  normal  0.119134 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3698  TonB-dependent receptor  37.8 
 
 		 961 aa  165  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 842 aa  163  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  25.38 
 
 		 836 aa  162  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02198  TonB-dependent receptor  36.56 
 
 		 1048 aa  162  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  25.22 
 
 		 972 aa  161  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  24.9 
 
 		 927 aa  160  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  33.78 
 
 		 943 aa  158  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  36.5 
 
 		 990 aa  158  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  35.67 
 
 		 1109 aa  158  6e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  33.23 
 
 		 1036 aa  157  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0253  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 1011 aa  156  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0016718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 838 aa  155  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  42.53 
 
 		 984 aa  154  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 868 aa  153  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  35.26 
 
 		 994 aa  153  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 		 944 aa  152  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  24.46 
 
 		 838 aa  152  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 		 961 aa  151  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  38.63 
 
 		 1011 aa  150  9e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  33.01 
 
 		 868 aa  150  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  35 
 
 		 914 aa  150  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  32.47 
 
 		 964 aa  149  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  34.96 
 
 		 1013 aa  149  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  23.23 
 
 		 943 aa  147  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1838  TonB-dependent receptor  32.25 
 
 		 979 aa  147  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.534381  hitchhiker  0.00298176 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  34.04 
 
 		 926 aa  147  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  41.83 
 
 		 986 aa  147  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  37.85 
 
 		 1047 aa  147  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  32.48 
 
 		 934 aa  146  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 917 aa  145  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  33.45 
 
 		 869 aa  144  7e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2991  hypothetical protein  23.22 
 
 		 1013 aa  143  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000283322  hitchhiker  0.000000325565 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  32.92 
 
 		 878 aa  143  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  32.6 
 
 		 878 aa  142  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  32.6 
 
 		 878 aa  142  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 874 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  32.6 
 
 		 878 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  32.12 
 
 		 870 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 945 aa  141  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  34.55 
 
 		 919 aa  141  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  34.38 
 
 		 982 aa  140  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  34.38 
 
 		 982 aa  140  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  40 
 
 		 874 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  35.31 
 
 		 978 aa  139  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 		 900 aa  138  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2831  TonB-dependent receptor  42.44 
 
 		 1017 aa  138  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312768  hitchhiker  0.00196838 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  30.85 
 
 		 872 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>